月经老是不干净，呈咖啡色可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：如果是腹部受凉导致的，建议注意一般治疗，即适当休息，适当使用温毛巾热敷腹部，有助于缓解症状。
2.使用药物：如果是宫颈炎导致的，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有头孢克肟胶囊、氨苄西林丙磺舒胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等。
一般情况下，如果来月经的第一天或月经即将结束时经血呈咖啡色，并且没有其他不适症状，一般是正常的生理鲜血，因为这种情况下，经血量较少，容易呈咖啡色。如果整个月经期间经血都呈咖啡色，则一般不正常，可能是腹部受凉、妇科疾病等原因导致的，女性需要做好腹部保暖，可以通过热水袋、热毛巾等物品来热敷腹部，同时，女性可以到医院进行相关检查，以明确病因，并进行针对性治疗。
对于月经第一天颜色呈深咖啡色是不正常的，正常的经血颜色为暗红色，刚开始量少，呈淡红色，然后逐渐加深。第一天颜色呈深咖啡色，考虑是有少量的出血，同时和腹部受凉、寒凝血瘀或肝气郁滞、气血不通有一定关系，可以适当地喝点红糖水，注意腹部的保暖。同时需要注意观察，有血块腹痛等，可适当地口服药物颗粒。
一般来说，月经咖啡色不正常。具体分析如下：
如果女性在整个月经期都出现月经咖啡色，而且出血量特别少，往往考虑是不正常的表现。这种情况下有可能是怀孕导致的异常子宫出血，比如宫外孕还要考虑是卵巢内分泌功能失调，没有排卵引起的无排卵型月经，还会导致月经周期推后不规律。
日常生活中，应当注意保持良好的阴部卫生，尽量穿柔软、透气良好的内裤，并需要勤洗勤换。
月经期间，如果出现咖啡色的月经，可能是妇科的炎症性疾病导致的，会对月经有一些影响。当患有阴道炎、子宫内膜炎、子宫颈炎等妇科炎症时，可能会出现月经颜色改变的情况，患者要注意观察自己的症状，看是否有痛经、阴道异常分泌物增多以及月经功能失调等情况，如果有，应及时就诊。患者也需要定期去医院做妇科检查，排除其它器质性病变。
月经量少伴有小腹疼痛，多与嗜食生冷寒凉，或者工作压力，情绪不畅。建议合理饮食，忌食生冷寒凉之品；缓解紧张情绪和压力，可以吃中药活血化瘀，调经止痛，如果有妇科炎症，需要积极消炎治疗。