同房第三天后吃避孕药有一定的作用。
一般情况下，紧急避孕需要在同房后的72小时内服用，并且服用的时间越早，避孕的机率也就越大。如果在同房三天后才服用避孕药，虽然也具有一定的效果，但是并不能保证避孕的机率。并且，服用紧急避孕药会具有一定的副作用，比如头疼、头晕、撤退性出血等，甚至影响到正常的月经。所以如果生育计划，在进行同房时最好进行正确的避孕。
避孕药第三天吃有用，通常使用的是紧急避孕药，具体分析如下：
在性生活后的第三天服用避孕药也有效果。避孕药的作用是在性生活后72小时之内，而且越早服药，避孕效果会更好。如果避孕药在第三天使用，并且在72小时内，则是有效的。如果超过72小时使用紧急避孕药的话，药效就会大打折扣。另外，避孕药的避孕效果也不是100%，如果一个月来月经推迟，还需要做尿妊娠试验，以排除意外怀孕。
一般情况下，吃紧急避孕药忌口三天是可以的。具体情况分析如下：
通常来说，女性在排卵期性生活之后，口服紧急避孕药，在服药的两个小时内禁食禁水即可，其作用是为了降低口服避孕药引起的恶心、呕吐等不良反应，降低避孕的作用。如果出现月经失调、内分泌失调等问题，建议不要频繁使用应急避孕药，一年之内最多吃三次。
如果三天用两次紧急避孕药，可能会影响到内分泌，出现月经紊乱，有一定的危害。
三天用两次紧急避孕药会造成阴道不规律流血，或者是月经提前。紧急避孕药属于大剂量的孕激素，如果频繁应用可能会影响到月经，另外也可以会造成避孕失败出现非意愿怀孕，所以不主张频繁应用这种避孕方法。在紧急避孕药以后，如果出现阴道流血要注意观察，如果量不多，并且几天就完全干净，可以不必用药物治疗。避免暴饮暴食，以防加重胃肠负担，影响机体营养摄入。适当进行体育锻炼等，可增强体质，提高机体免疫力，维持机体健康状态，减少不良病变的发生。
三天吃两次紧急避孕药的危害如下:
1.不规则阴道出血。
2.月经提前或推迟。
3.恶心、呕吐、腹胀、头晕、头痛、乳房疼痛等。
4.避孕失败也可能导致意外怀孕。
紧急避孕是孕激素的一种，能抑制排卵，阻止卵子和精子结合，改变子宫内膜状况，抑制受精卵着床。紧急避孕药不建议常规使用。如果没有生育要求，可以选择放置宫内节育器和避孕套避孕。
一般情况下，三天服用两次紧急避孕药，对患者的身体是有一定的影响的。正常情况下，女性一个月之内最多服用一次紧急避孕药，因为紧急避孕药是一种激素药，其中含有孕激素、雌孕激素复合制剂，这些成分可能会扰乱女性的内分泌，使女性的月经出现异常。需要注意的是，紧急避孕也可能会有避孕失败的情况，且紧急避孕药可能会导致输卵管蠕动异常，严重时还可能会使女性出现异位妊娠的情况。