输尿管结石伴肾积水时，超过一公分以上的结石大部分需手术取石，小于一公分的结石可在医生指导下通过饮水和跳绳等保守方式来排石，另外，日常生活中应预防高尿酸血症，避免高嘌呤饮食。
输尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
如果结石大于0.5厘米小于1.2厘米，结石嵌顿的时间不长，肾积水不严重，可以考虑体外震波碎石。如果结石在输尿管下段，怀疑有肉芽组织包裹，建议行输尿管镜钬激光碎石。如果结石在输尿管上段，可以考虑输尿管软镜或者经皮肾镜手术。
可以进行体外冲击波碎石，碎石后结石排出输尿管梗阻恢复通畅，则肾积水即可消失。如果结石巨大，并且是多发结石，呈石街样改变，可以行腹腔镜输尿管切开取石或手术开放切开取石。
及时的去医院做个肾脏彩超或者是尿路造影，有堵塞需要及时碎石或者手术取石治疗。输尿管结石肾积水，影响了新陈代谢，输尿管结石肾积水的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧、有无尿流梗阻、伴有感染、肾功能受损程度。