孩子脑积水病因导致小孩脑积水有很多因素，主要表现在脑脊液分泌，小儿脑积液分泌量过多，可导致脑袋积水，小孩再发育时，侧脑室脑脉络丛严重增生，造成脑脊液分泌过多。另外一个因素就是由于血液中含有一些有害物质如蛋白质、胆固醇等成分而产生的沉淀，这些物质进入到大脑内影响了孩子正常的血液循环，从而使得脑部供血不足出现症状。脑脊液分泌量过多，脑积液的吸收功能亦存在障碍，可使脑积水加重，儿童脑脊液循环通道障碍，亦为脑积液之诱因，先天发育阻碍脑脊液循环障碍，例如，孕妇孕期发烧或吃避孕药，均可导致小儿发育不良。
胎儿脑积水主要病因是宫内感染、宫内脑出血、脑部发育异常、畸形、肿瘤等，感染、脑出血会使脑脊液混杂白血病、红细胞、脓液等杂质，引起脑室系统黏连、脑脊液吸收的途径不畅，导致脑脊液吸收障碍，分泌吸收不平衡，形成脑室扩大。脑部发育异常、肿瘤等压迫影响了脑室系统脑脊液循环，从而引起颅内压增高，脑室系统扩大形成脑积水。
多数情况下见于一些颅脑损伤导致出现的脑积水，比如动脉瘤破裂或者是后天的因素导致的蛛网膜下腔出血，动静脉畸形都有可能会导致脑积水，主要是由于在脑部出血了以后，血液沉积在脑组织表面，导致蛛网膜颗粒黏连，从而造成脑脊液吸收障碍，脑脊液吸收较差，而脑脊液产生正常，造成脑脊液越来越多，从而形成脑积水的情况。
胎儿脑积水的原因主要是先天性因素导致的，有一些是先天性的基因突变导致胎儿产生脑积水。有些是因为化学、物理因素，特别是在怀孕期间，受到辐射，受到化学药物的刺激，引起的基因突变，导致脑发育不全，形成脑积水。
胎儿肾结石脑积水通常是由于钙盐在肾中沉积而引起。
胎儿肾结石脑积水可能是钙盐在肾中沉积而引起，也可能是和孕期的妈妈接触到了某些放射线、化学物质和口服某些药物是相关的，还与其发育异常有关。严重脑积水很容易造成脑组织坏死或者死亡。轻微的脑积水可不予治疗，部分可于妊娠晚期自行吸收，而且脑积水的话尤其严重，那多半是并发了别的畸形。
颅脑内部是存在脑脊液的，也就是存在液体的，这种液体是循环的，就是它不断的产生，产生了之后通过一定的渠道流到其他的部位，然后再由其他的部位来吸收。当产生的过多了或者是流通的渠道当中出现了梗阻，或者是吸收存在问题的时候，就会造成水多，这就是脑积水，造成刚才说到的这些水产生过多了，然后流通的渠道当中存在梗阻了或者是吸收障碍的这些原因都可以造成脑积水。
