对于慢性肝炎早期的治疗。应用相关药物通过抑制病毒的聚合酶，能够有效的抑制HBV的复制，使其达到检测不到的水平，但是在停药以后血液中的病毒经常会回升，主要是因为HBV共价闭环DNA(cccDNA)中活跃的转录模板的存在。因此需要清除cccDNA和杀灭被感染的肝细胞。还能间接增加抗病毒的免疫作用，具有双重功效。
慢性肝炎一般不好治。
慢性乙肝是目前我国比较常见的一种疾病，主要是由于乙肝病毒感染引起的，慢性乙肝患者会出现肝脏炎症，导致肝脏纤维化，进而发展为肝硬化甚至肝癌。慢性乙肝目前不能治愈，但是可以控制慢性乙肝，主要以抗病毒治疗为主。目前口服抗病毒药物至少需要4年以上的时间，部分患者需要终身服药，可以在医生的指导下服用恩替卡韦分散片、复方甘草酸苷片、还原型谷胱甘肽片等药物。
慢性乙肝的病理特征是肝脏弥漫性损害，表现为气球样变，而各种类型的慢性肝炎的病理特征也不尽相同。
长期的肝损害是由于某些原因造成的，如果不及时清除，就会造成反复的损害。在慢性肝炎的治疗中要明确原因，同时要做好护肝降酶等相关的措施，消除病因是治疗慢乙肝的重要措施，对于慢乙肝，可以选择抗病毒等药物进行全面的治疗。
乙肝、丙肝病毒感染是慢性肝炎，首先要做好抗病毒治疗。饮酒、脂肪肝引起的肝炎要注意戒烟，平时要注意养成良好的饮食习惯。
此外，慢性肝炎是由不合理的药物引起的，也有可能是自身免疫性肝炎。在此基础上，通过综合的方法，如保肝护肝、利胆消炎等，可以有效地控制大部分的慢性肝炎。
建议患者在生活注意休息，避免进行重体力劳动。
抗病毒、免疫调节、抗炎保肝、抗纤维化、抗纤维化等是慢性肝炎肝损害的治疗目的。
具有抗炎、保护肝细胞、增强肝功能等作用的抗炎护肝药物种类很多。常用的药物有：甘草酸制剂、熊去氧胆酸、双环醇、还原型谷胱甘肽等。有明显的临床表现或严重的病人应该躺在病床上；康复期间可以逐步加大运动量，但是要尽量不要过度劳累，尽量做到运动后感觉到疲劳。
慢性肝炎分为慢性迁延性肝炎、慢性活动性肝炎两种，属中医黄疸、胁痛、积聚等范畴，根据临床辨证可分为：肝脾湿热，肝郁气滞，肝血瘀滞，肝郁脾虚，脾虚湿蕴，肝肾阴虚，脾肾阳虚等证型。