相比来说胃镜比喉镜痛苦一些。
胃镜下的管子很粗，需要从咽喉、食道进入胃腔，这段时间由于与食道的摩擦，会对食道和胃粘膜产生损害，在进行胃镜后会出现胃部不适。喉镜的导管很薄，从鼻子到喉咙，病人会有呕吐的症状。所以相比来说胃镜比喉镜痛苦一些。如果患者的抵抗性较差，可以选择无痛胃镜，可以在一定程度上改善患者的不适症状。
做电子胃镜比电子喉镜更痛苦些。电子胃镜是由口内下到胃里，再上拖，非常痛苦。如果是咽喉的炎症，做喉镜就行了。如果检查食管和胃的疾病，可以做胃镜。
检查喉镜时间更长，检查时间喉镜要比胃镜短的多，价格也少的多。虽然现在很多医院已经开展无痛胃镜检查，但麻药过后还是有点难受。
建议患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。
胃镜和喉镜检查的部位不同，属于不同的科室，不可以同时做。
胃镜检查在临床上主要是消化内科用于胃部疾病的患者，通过电子光学仪器对人的食道和胃内部的情况做检查、了解疾病情况；喉镜是耳鼻喉科医生用于了解患者咽喉内部情况的仪器检查。两者检查的目标是人体的不同器官、针对不同疾病的检查，不能互相代替，且不可以同时进行。
需要做胃镜和喉镜检查最好到医院挂消化内科和耳鼻喉科，在医生指导下进行相关的检查；如果患者需要做两种检查则结合自身情况选择先后顺序，另外医院做检查人数较多一般需要通过预约来确定具体检查时间。
胃镜的费用一般在300-400元之间。
胃镜检查是利用一条直径约一公分的黑色塑胶包裹导光纤维的细长管子，前端装有内视镜由嘴中伸入受检者的食道→胃→十二指肠，藉由光源器所发出之强光，经由导光纤维可使光转弯，让医师从另一端清楚地观察上消化道内各部位的健康状况。必要时，可由胃镜上的小洞伸入夹子做切片检查。一般情况下，就是普通的胃镜一次在260元左右，无痛的胃镜一次就是在850元左右。
喉镜能查出喉癌，电子喉镜在喉癌的初筛中具有重要的意义。在电子喉镜直视下能够看到咽喉部具体情况，会厌喉面是否有新生肿物、声带是否有新生肿物出现、梨状窝处是否有异常。喉癌分声门上的会厌癌容易发生转移，愈后不好。
喉镜可以查出占位病变，只有病理检查才可以确诊。息肉和喉癌都是肿物，但是喉癌是恶性的，它会侵犯其他组织，并且会长的很快的，导致机体越来越差的，而息肉，虽然说是个肿物，但是它不会长的很快。