乙脑灭活疫苗与减毒疫苗有很大的不同之处，就是因为乙脑灭活疫苗是由死病毒制作而成，副作用比较小，要经过多次的注射，才能在婴儿体内产生抗体。
反复的注射会使婴儿的疼痛和副作用的发生率提高。乙脑减毒疫苗是一种活疫苗，有一定的免疫排斥作用，副作用比较大，但是免疫效果好，接种次数少，对孩子的危害小，更容易为父母所接受。所以，乙脑减毒疫苗优于减毒疫苗。
乙脑疫苗比较安全，仅有少数小儿会出现不良反应。注射乙脑疫苗后可出现发热，还可出现头痛、头晕、乏力、寒战等全身症状，也可出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状，一般在1天内可自然消退。注射乙肝疫苗后还可出现局部不良反应，如注射部位发红、肿胀、出现疼痛、皮温升高等，局部的不良反应一般持续数个小时。
乙脑疫苗包括乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，两种疫苗的接种时间是有区别的。首先是乙脑灭活疫苗是国家规定基础免疫共注射两针，出生后满6个月的婴儿，开始接种第一针，7到10天后接种第二针，一岁半到两岁左右，以及四岁的时候，各加强一针，六岁的时候再加强一针。其次是乙脑减毒活疫苗是1岁的时候接种第一针，2岁时加强免疫一针，7岁时再加强免疫一针。
乙脑疫苗通常需要注射三次左右，因为注射三次左右才会产生抗体才会有免疫力，这样才可以有效的预防宝宝发生疾病。有些打完疫苗后没有产生很好的抗体还需要在注射一次，一定要按时给宝宝进行注射疫苗，打疫苗的时候也要在宝宝没有生病的情况下进行注射。
是慢慢会被吸收的，但是必须要注射的，因为是肌肉注射，很快就会被机体吸收，所以会很快地进入血液循环，24小时内不要洗澡，以免针眼儿处接触水之后感染，造成疼痛、红肿等症状。
打了乙脑疫苗不能吃辛辣刺激性的食物，比如葱、姜、蒜、辣椒。不能吃发物，比如鸡肉、羊肉、牛肉、鸡蛋、牛奶。戒烟，戒酒，避免过度劳累。不能吃海鲜类的食物，比如鱼、虾、螃蟹、海带等。不能吃易过敏的食物，比如西红柿、芒果、蘑菇等。多吃新鲜的蔬菜水果，比如苹果、香蕉、橙子、菠菜、油菜、芹菜。注射狂犬疫苗以后24小时之内不能洗澡。
