腺垂体功能低下症的治疗方法有两种，一是对症治疗，二是病因。腺垂体机能低下，一般由拉克氏囊肿引起，或由颅咽管瘤压迫造成。
所以，治疗腺垂体功能低下症，首先要解决病因。可以选择经鼻蝶入路切除或拉克氏囊肿。在外科手术中，可以使用神经内镜，也可以在显微镜下使用。
手术切除后，如果腺垂体功能还没有完全恢复，可以进行相应的治疗。
垂体功能减退症指多种因素的影响，破坏下丘脑-垂体通路所致单一，孤立垂体激素，各种垂体激素局部或全部分泌不充分的病症。
其临床表现与其内分泌系统故障相似。垂体完全或绝大多数遭到破坏时，就会出现内分泌腺功能下降等一系列表现，主要受累腺体是性腺和甲状腺，以及肾上腺皮质。儿童腺垂体功能减退症以其发病年龄小，病程短，临床表现多样化且容易误诊误治等特点，成为内分泌领域研究的热点之一。在儿童期及成年期均可见，儿童期比较罕见，产伤之外多数是先天性胚胎缺陷，例如无脑儿等，垂体不发育、嗅觉及性功能障碍。儿童腺垂体功能减退症多发生在青春期以后。成人腺垂体功能减退，其常见原因是产后垂体缺血性坏死综合征和垂体腺瘤。
腺垂体功能减退症的一般处理，一般的处理方法有加强营养和注意保暖等，尽可能避免感染，应激，外伤，疲劳，寒冷诱因产生。
对于一些症状严重且持续存在者，则要考虑到手术以及使用肾上腺皮质激素的可能。部分病人起病初未能明确诊断，晚期需手术或需镇静药物治疗，可引起垂体危象。对于此类情况，如果不能及时发现时会给病情发展带来严重影响，甚至危及生命。在此情况下，应及时进行确诊，并且避免诱因是至关重要的因素，发生腺垂体功能减退症后，评估激素水平之后，要适时补充内分泌激素。
腺垂体功能减退症有如下功能改变：
一、性腺机能减退。以产后羞耻、乳房萎缩、必经、乳晕色淡、毛发稀疏。
二、缺乏甲状腺激素。其主要症状为食欲减退，胃寒，皮肤干燥无光泽，记忆力减退，视力减退，表情淡漠，行动迟缓。
三、肾上腺素不足。症状有：极度疲劳，虚弱，厌食，恶心，呕吐，感染，低血糖等。
建议患者需要及时就医治疗，不要浪费治疗时间。
儿童腺垂体功能减退症的激素替代治疗需要保持根据需要来补充。
儿童腺垂体功能减退症的激素替代治疗的原则是按需要来进行补充。要注意保证肾上腺皮质激素，甲状腺激素，性激素，和生长激素的基本生理需要。同时还要注意不能替代过度。建议在医生的指导下进行治疗，根据血电解质的水平来判断患儿的基本情况。，糖皮质激素替代过渡时很容易出现生长发育障碍和低补量等不良反应。
腺垂体功能减退症一般需与神经性畏食、原发性甲减等疾病相鉴别。
1.神经性畏食：会出现食欲减退、怕冷、闭经等症状，常见于年轻妇女，并有精神创伤史，由于饥饿病人的生长激素水平在正常或上限时，除了性功能减退，其他情况下不会出现甲状腺肾上腺皮质功能低下。
2.原发性甲减：除了甲状腺机能下降外，还会引起其它内分泌器官的机能下降，故常会被误诊为腺垂体功能减退，原发甲减以粘液性水肿外观为主，血胆固醇升高较多，常伴有心脏增大。