跑步时膝盖内侧疼痛可能是，膝盖内侧的鹅足出现了炎症，鹅足是有几个肌腱共同汇聚在膝关节的内侧而构成的组织，当出现炎症或者慢性劳损时就会出现运动时的疼痛。或者是内侧副韧带止点的疼痛，内侧副韧带是稳定膝关节内侧的重要的结构，防止膝关节的外翻，长期跑步膝盖内侧的疼痛可能是由它的损伤造成的。还有可能半月板的损伤，当半月板的体部或者前角出现了撕裂，这时就会出现跑步时膝盖内侧的疼痛。
跑步过程中会有一侧膝关节的疼痛，这种疼痛主要是由于长期劳损性疾病造成的，特别是膝关节的骨性关节炎和膝关节的滑膜炎。
如果跑步的时候姿势不合适，体重过重，或者长期的奔跑，都会造成膝关节的滑膜反复的压迫，局部充血水肿，从而形成无菌性的炎症，从而产生炎症性细胞因子。例如前列腺素因子，会刺激周边神经，从而造成局部疼痛。长期跑步会引起膝关节关节软骨的反复挤压和摩擦，从而出现退行性变的骨性关节炎，同时还会引起膝关节的疼痛，特别是在登山的过程中，这种疼痛会加重。当然，如果在跑步过程中出现一侧膝关节的疼痛，也要考虑是不是因为半月板、十字韧带等长期的损伤。
跑步引起膝盖疼痛的原因，主要可能是因为，长时间不运动，突然跑步，通常会导致关节周围肌肉疲劳，出现酸痛，主要表现为股四头肌的酸痛。其次，如果是骨关节炎，关节内部磨损，跑步时会导致关节滑膜分泌炎性积液，导致疼痛，半月板损伤也会导致跑步时出现卡压疼痛。还有膝盖疼痛，如髌骨关节炎、髌骨软化等。需及时就医进行明确。
通常来说，膝盖疼不可以跑步。
膝关节局部疼痛可能是由于膝关节有骨性关节炎、滑膜炎等关节炎、膝关节局部韧带、半月板损伤、病变等引起的。在这种情况下，需要注意膝关节的休息和保暖，要尽量少运动，避免出现剧烈的运动，长期的运动会对膝关节造成一定的伤害，从而引起膝关节的疼痛。所以通常来说，膝关节有疼痛感时尽量避免进行长距离的锻炼。
一般情况下，一跑步膝关节就出现疼痛症状，常见以下几种原因：
第一、对于年轻患者与运动过量有关，由于骤然增加的或者不恰当的这种运动，所导致的髌骨或者与髌骨相对的股骨关节面的软骨损伤。
第二、对于老年患者，既往有膝关节相关疾病的病人，比如有膝关节内的滑膜炎或者是骨膜囊肿这类的疾病，经过跑步刺激后会产生疼痛加重的现象，最好选择游泳替代跑步，可明显改善关节疼痛症状。
跑步膝盖疼是否还能跑步，需要根据具体的情况来判断，具体分析如下：
如果在跑步过程中膝关节疼痛，建议立即停止奔跑，避免进一步加剧受伤和痛苦。可以进行热敷，休息后没有任何好转，建议到正规的医院进行x片，确定有没有半月板韧带、滑膜等疾病，然后针对原因进行针对性的处理。等彻底康复后，可以逐步进行锻炼，避免过度的剧烈运动。