先天性的癫痫的治疗主要的应该用药物治疗才行的另外就是有一定的遗传性。结合病史，临床症状及脑电地形图诊断，可以是口服抗癫痫药物治疗的，注意监测癫痫血药浓度，控制癫痫平稳的可以看染色体有无异常的情况再考虑。
小孩患有先天性心脏病，如果是不足1个月的孩子或者是三岁以内，可以暂用药物治疗等到两岁或者三岁左右再进行外科手术治疗。先天性心脏病，少数可以自然恢复，但是绝大部分都会随着年龄的增长，出现不同的并发症，而且症状会越来越重，在治疗上，可以选择药物的保守治疗，但是药物治疗只能控制症状，不可以治好，还是建议手术治疗。
主要是使用青霉素药物的方法进行治疗，治疗时药物剂量应足够，疗程应规律，不规律治疗是引起复发梅毒、隐性梅毒的重要原因，晚期隐性梅毒，可在早期隐性梅毒的基础上，增加一个疗程。
女儿患有先天性腮瘘通常应及时进行治疗。
先天性腮瘘是由于胎儿在发育过程中咽喉部导管没有闭合。由于伤口裸露在外面，容易发炎、化脓，长期以往很可能导致恶变，只有手术才能解决问题。如果是腮瘘，需要做碘油造影，或者用造影剂注射造影剂，做X线或CT检查，看看鳃裂囊肿有没有内瘘。一般情况下，鳃裂囊肿是有瘘管的，有外瘘的，也有内瘘的。在做手术之前，必须先确定有没有外瘘或者内瘘。术中应沿囊肿包膜切除囊肿，同时切除瘘管，封闭瘘口。
癫痫不适宜参加剧烈的体育活动和大量的运动，如长跑，长跑往往是由于过度换气的现象，而过度换气由于二氧化碳的过度排放，从而使体内产生呼吸毒性发作引起的，特别是诱发失神发作和强直-阵挛性发作。虽然大运动量的足球，篮球应该避免，潜水，游泳不应该参与，因为如果这些项目还伴有癫痫会导致任何意外。
先天性癫痫疾病属于神经科疾病，对于癫痫挂号要到神经科，但是神经科也是有区别的，分为神经外科和神经内科，病患一定要搞清楚，当第一次治疗先天性癫痫的时候要到神经内科去检查治疗，手术治疗是在神经外科挂号的，要清楚这些治疗的科室。