引起胚胎停育的原因太多了，染色体发育异常是造成胚胎停育的最大元凶，而造成染色体异常的原因有辐射、药物、食物激素等影响，或者使用了不合格的护肤品、指甲油等，因为这些产品可能会含有甲醛等致畸物质。
胚胎停止发育可能跟男性精子质量差有关系，常见原因有染色体异常、免疫功能不全、内分泌功能紊乱、子宫内环境异常、遗传性血栓形成倾向、全身感染性疾病等女性危险因素、精子成熟障碍等男性危险因素、环境不良等因素。
生殖道解剖结构异常，内分泌异常，生殖道感染，血栓性疾病因素，免疫因素，其他尚有男性因素，都是导致胎停出现的原因。现在需要检查明确导致胎停的原因，针对性调理确保下次安全孕育。
有的没有症状，先天淘汰的结果，可能DNA出现异常，但是也有的是黄体功能不足。早孕期注意休息，如果出现阴道分泌物异常、早孕反应突然消失、或有腹痛的情况需及时到医院检查。
如果胚胎停育的现象只是出现了一次，女性完全不必担心下次的造人计划，有超过75%的胎停育女性下一次仍然可以正常怀孕。胎停育半年之后，夫妻就可以开始为下一次怀孕做准备。有很多经历过胎停育的女性在第二次备孕时会尤其紧张，因为担心胎停的现象会再次发生，这种紧张的心态会严重影响备孕的顺利性，导致女性难以怀上。
胚胎停育的原因包括：一、遗传因素。如果本身存在先天性遗传基因缺陷、染色体异常等问题时，就会增大发生胚胎停育的几率，常见的遗传基因缺陷主要是精子染色体异常或者卵子染色体异常。二、激素分泌不足。激素分泌不足也是一个导致胚胎停育的主要因素，激素分泌不足就会导致胚胎发育受到影响而造成停胎。三、子宫腔畸形。