是因为呼吸系统有感染。在夜间的时候，呼吸系统会分泌炎性的分泌物，也就是痰液，容易积聚在呼吸道内，比如支气管或者肺泡内。在早晨起来之后机体为了排出炎性的物质或者痰液，所以会咳嗽的比较厉害，有利于炎性物质的排出。
需要看咳嗽的时间是多长，如果咳嗽的时间比较长，症状比较严重，那需要进行进一步的检查，比如胸片，血常规。是感染因素引起的，那需要应用抗生药物控制感染的，是非感染因素引起的，是气道的高反应性，那可以雾化吸入的。
早晨咳嗽厉害都是考虑慢性咽炎导致的，可能是慢性咽炎，多发生于成年人，常伴有其上呼吸道疾病，常因急性咽炎反复发作、鼻炎、鼻窦炎的脓液刺激咽部，或鼻塞而张口呼吸，均中导致慢性咽炎的发生。慢性咽炎与吸烟有一定的关系，治疗应先从戒烟开始。
需要去医院检查一下。查一下血常规。看看是那种炎症感染引起的。有针对性的用药治疗。这几天注意不要受凉，如果确诊是支气管炎是可以采取雾化治疗，配合输液，密切观察疾病的治疗进展。
一般情况下，支气管炎患者早上咳嗽厉害，可能是天气变化、过敏等因素引起的。
昼夜温差大，如果早上起来时没有做好保暖措施，可能会支气管炎患者早上咳嗽厉害。如果早上起来没有做好防护，吸入大量粉尘，也会导致支气管炎患者早上咳嗽厉害。建议及时应用一些克拉霉素、氯雷他定、肺力咳合剂、氨溴索分散片等。治疗期间注意清淡低盐饮食，尽量避免吸烟饮酒，减少高蛋白、高热量、刺激性、生冷食物的摄入。还可适当进行体育锻炼，有助于增强体质。
可能是发生了呼吸系统的感染，呼吸道会分泌大量的炎性分泌物。经过一夜的睡眠，呼吸道内会堆积大量的炎性分泌物也就是痰液，早上起来为了排除痰液，就会出现剧烈的咳嗽。