低位复杂性肛瘘的症状有肛门间歇性或持续性流脓。—般无疼痛感，仅觉肛门口坠胀或坠痛，当脓液引流通畅后肿痛马上减轻。有时可因内口较大，粪便流入管道而引起疼痛，尤其是在排便时疼痛加剧。
肛瘘分为高位肛瘘和低位肛瘘，大概两周到三周就能长上，低位肛瘘创口是比较浅的，大概三周左右，就能够完全好，而且饮食上也不需要禁食，不过具体的恢复时间也是因人而异的，手术后积极做好肛门护理，可以温水坐浴或者直接热敷，并多吃可以通便的食物，防止因大便不通畅影响到肛门恢复。
低位肛瘘属于肛瘘中治疗难度相对较低、愈合相对较快，远期治疗效果相对较佳的一种，大多需要在麻醉下行肛瘘切除术，术后需要遵医嘱定期复诊，伤口换药，使用抗菌药物治疗促进愈合。术后两周左右即可恢复。要注意肛门口卫生，便后及时清洗患处，避免吃辛辣刺激性食物。
一般高位性肛瘘手术之后，由于伤口比较大，还有可能合并感染的情况。可以出现伤口不好恢复好，不好愈合的情况。如果有感染，需要控制好感染。到医院复查看看如果有感染的情况，需要清理好伤口。如果脓肿只是切开，没有做肛瘘治疗。也可以引起经常流脓的情况，那就需要到肛肠科做肛瘘治疗术的。
一般在30天可以恢复，肛瘘是常见的肛肠疾病，是肛门周围皮肤与直肠之间形成了异常通道，大多需要手术治疗。高位复杂性肛瘘治疗比较麻烦，有些需要多次手术治疗，才能完全恢复正常。要清淡饮食，多吃蔬菜和水果，避免油腻辛辣刺激性食物，多做提肛运动，戒除烟酒。