疱疹性咽峡炎后期会咳嗽，咳嗽是人体清除呼吸道内的分泌物或异物的保护性呼吸反射动作一般由感冒引起。得了疱疹性咽峡炎不会有咳嗽反应。虽然感冒与疱疹性咽峡炎均属于急性上呼吸道感染但疱疹性咽峡炎的病灶主要在于咽、软腭、悬雍垂(口腔中软腭后缘正中悬垂的小圆锥体。
小儿疱疹性咽峡炎在水果方面没有饮食禁忌，通常都可以吃。
疱疹性咽峡炎不会影响到饮食，如果是痛苦的，可以选择清淡的、刺激性的、柔软的、富含维生素、纤维素、微量元素的水果。对于水果的禁忌并没有太大的要求，可以多吃些水果，这样不仅可以补充营养，还可以增加我们的免疫力，可以多吃些蛋白质，膳食纤维，碳水化合物，新鲜蔬菜，比如萝卜，当归，还有就是多吃西瓜，不能吃辛辣刺激性的食物，也不能吃海鲜等油腻的东西，还要多喝水。
半夜咳嗽，白天没事可能和自身着凉以后引起的病毒性和细菌性感染所引起的呼吸道增高有直接关系，也有可能是因为宝宝对空气中的花粉、异常的气味过敏所引起的咳嗽，导致出现变异性的哮喘，有可能是属于鼻炎以及鼻窦炎，必要的时候可以到医院做相关的检查，比如血常规和胸部X线检查，根据自身的检查结果，在医生的指导下采用抗感染药物治疗。
疱疹性咽峡炎属于是病毒感染，水果之类的都可以吃，但是要注意清淡饮食，不要吃太油腻的肉食，不要吃海产品之类的，不能吃辛辣刺激性的食物，这些食物会容易导致疱疹病毒繁殖旺盛，容易导致疱疹病毒的爆发。
疱疹性的咽峡炎会出现咳嗽，但是此时的咳嗽往往是刺激性的干咳，不太严重，也不会太深。出现疱疹性咽峡炎的时候，咽喉部会有疱疹，所以会刺激咽喉部出现咳嗽。另外，咽喉部还会有充血和水肿，还会有少量的炎性渗出物，也会刺激咽喉部以及气管出现咳嗽。
可以使用抗病毒药物治疗，疱疹性咽峡炎是由于疱疹病毒感染引起的咽峡部炎症，是具有传染性的，所以首先要做好消毒隔离，避免到人多的公共场所。同时饮食上增强营养，多吃一些鸡蛋，鱼虾，瘦肉等富含蛋白的食物。