可以做细针穿刺检查，取组织做病理检查，是有创伤的检查但比较可靠。还有就是放射性核素检查，观察热结节和冷结节等判断方法。良性的甲状腺结节一般变化很慢，几年也就是长大一点点。恶性的增大速度快，身体容易变得消瘦。是无痛性结节。
一般来说，甲状腺结节良性和恶性可以通过肉眼观察、病理检查等方式区分。
1、肉眼观察：良性甲状腺结节边界清楚，表面光滑，包膜完整，形态规则；而恶性甲状腺结节则边界不清楚，表面不光滑，包膜不完整，质地比较硬。
2、病理检查：甲状腺良性结节与恶性结节，可以穿刺或者手术后病理检查，这样的检查结果最为准确。
甲状腺结节的性质有了变化，建议尽早手术。
如果在临床上出现了甲状腺肿大的情况，则要考虑是否患有结节性疾病，或者是甲状腺机能亢进等其他原因引起的慢性炎症问题。甲状腺结节通常是良性的，没有明显的不适感，通常无须处理。如果发现后未及时诊治，会对人体造成一定的危害。结节性质的变化，很可能结节病变加重了，此时需手术处理。对于甲状腺结节性增生，恶性结节及钙化性结节等均应及时采取外科手术切除或活检方法予以明确诊断并给予相应治疗。甲状腺结节的患者在日常的饮食中应该引起重视，勿食辛辣刺激性食物，不要吸烟，不要饮酒。平时要保持健康良好的生活习惯，坚持定期体检，定期检查自己的身体情况。多吃鲜蔬菜水果，食消肿散结之品。
不能根据低回声或是高回声来判断甲状腺结节的良恶。甲状腺低回声结节，是B超描述下甲状腺结节的一种表现。甲状腺结节的性质，诊断要依赖于病理学的检查结果，可以让患者在B超定位下做甲状腺结节的细针穿刺，送组织细胞进行活检，根据病理学的结果，才可以看到甲状腺结节良性还是恶性。如果结节较小并且不影响甲状腺的功能，可以定期检查，如果发现已经癌变，就要进行手术治疗。
甲状腺有多发性结节，其性质保留，说明此时无法判断甲状腺结节是否发生恶性病变。
最好的方法是每三个月或五个月对甲状腺进行超声检查，同时检测甲状腺激素水平。甲状腺结节80%左右为良性，具体见甲状腺结节描述。结节内有钙化，结节表面不光滑，结节纵横比不均衡，或结节生长速度过快，周围有淋巴结肿大，提示甲状腺结节可能是恶性病变。也需注意甲状腺结节、超声分级。3级以下，多发性结节大部分为良性。四级至结节可能发生恶性病变，等级越高，恶性病变发生的概率越高。甲状腺结节5级，恶性病变发生率约85%以上，应定期复查。
鉴别甲状腺结节性质可以从以下几个方面进行：
一、从患者的症状来看，如果患者症状中有声音嘶哑，就要考虑是否有恶性、呛咳、气管压迫症状等。二、是从体格检查方面来看，如果这个结节质量硬，很有可能是恶性的。肿瘤非常软时，一般为良性，其恶性可能性较低。三、特殊检查，如超声检查，所有甲状腺结节首选检查都是超声检查，超声检查可以非常明确地判断甲状腺的这一性质，如良性是甲状腺结节边界比较清晰，血供不太丰富。另一方面，恶性的一般情况是甲状腺边界不清晰。而且，其纵横比，也就是前后径大于其左右性，纵横比大于1，里面有细小的钙化。这些都是恶性的象征。