腱鞘囊肿治疗方法有手术与非手术治疗两种，在这些腱鞘囊肿中，有一小部分病人可自行消退，但是有些病人在经过各种治疗后仍复发，非手术治疗和保守治疗的复发率比较高，但是这类方法的创伤最小，容易为病人所接受，临床可作首选治疗。
可经挤压致使腱鞘囊肿断裂而渐渐自行吸收，但在治疗之后，可反复发作，连接关节腔不易断裂，可通过穿刺将囊液拔出，再加压按压或拔出囊液，送入肾上腺皮质激素进行局部加压包扎，一般均能起到治疗作用。
手术治疗是指在其他治疗无效的情况下，腱鞘囊肿可手术摘除，但仍存在不同程度的复发机会，故术后需避免病部关节不断重复连续运动和剧烈运动，为了避免再复发的可能性。
在临床上，如果病人发生左足背腱鞘囊肿，其病因是由于病人足部活动量过大，或者慢性的劳累、劳损、外伤等原因而导致。
在治疗上首先可以采取保守治疗，嘱咐病人减少活动，避免劳累。左足背腱鞘囊肿一般不会出现明显的临床表现，只要平时多休息即可，不能进行局部重复的推拿。如果是肌腱鞘囊肿的体积越来越大，并且有一定的痛苦，可以通过穿刺取出其中的汁液，再用激素或者是手术摘除。
脚背腱鞘囊肿的治疗主要是非手术治疗或者外科治疗。
脚背腱鞘囊肿是由于脚背和足踝部的关节活动频繁，在活动时会受到很大的压力。如果发现有腱鞘囊肿，可以选择非手术或者外科。一般采用挤压法、穿刺等非手术方法，挤压法可以使腱鞘囊肿破裂，慢慢的自行吸收，但也有一定的复发率。与关节腔相连的囊肿不易破裂，可以通过穿刺取出囊液，再用肾上腺皮质激素或玻尿酸酶进行压迫包扎。如果其它治疗方法不能奏效，则可以通过外科手术将其切除。在手术后一定要避免剧烈的运动，以免再次发生。甚至外科手术都有复发的可能。
足部腱鞘囊肿可以通过注射器抽出内容物、药物治疗、手术治疗等，具体分析如下：
建议先密切观察，如果不会对生活造成明显的影响，可以继续观察，因为腱鞘囊肿是一种良性的疾病，不会出现恶性病变。此外，如果是大的腱鞘囊肿，可以用注射器将囊肿囊内的囊腔抽出，然后注入曲安奈德，再进行适当的压力和包扎，这样就能完全恢复了。另一种是通过手术直接将囊肿完全切除，但是仍然存在着一定的复发率。
治疗膝关节滑膜囊肿的常用方法是直接粉碎，无创性但粉碎过程有点痛苦。粉碎后可用硬币压住受累部位，或不时用力压住使增生的滑液沿粉碎的囊肿壁流出，减少复发的机会。如果囊肿没有被压碎，可以在局部麻醉下用注射器抽吸，取出囊肿中的胶状液体，然后加压包扎。如果出现疼痛等症状，应考虑手术治疗，直接剥除整个囊肿，然后缝合关节囊开口。这种方法治疗更彻底，复发率最低。此外应该尽量避免冷水刺激，减少活动和更多的恢复。
腱鞘囊肿可以采用传统的中药按摩或者针灸来治疗。平时要多运动关节，不要做太久的单性运动，否则会导致病情恶化。腱鞘囊肿是一种肿物，不是肿瘤，而是囊肿增大引起神经压迫，出现手麻或臂麻的情况，如果病情比较轻微，可以用按压、按摩、慢慢揉开等方法进行治疗，但是一旦出现反复发作的情况。如果情况比较严重，可以进行手术切除，术后要及时口服消炎药，避免感染。