霉菌性食道炎可通过使用药物进行治疗。霉菌性食管炎主要是由白色念珠菌入侵食管黏膜，而形成的一种溃疡性伪膜性感染所致。主要是给予抗真菌治疗，胃镜发现的时候可以喷洒药物，起到杀菌的作用，而且副作用也比较小。平时不要滥用抗生素和激素药物，治疗使用中药常见有锡类散、云南白药、大蒜素等，西药常见有制霉菌素、二性霉素B、酮康唑、氟康唑、伊曲康唑等，对抗霉菌治疗均有效。
霉菌性食道炎吃抗生素、二性霉素B等药。
霉菌性食管炎可以口服抗生素、二性霉素B、伊曲康唑、锡类散、酮康唑等，还可以口服益生菌、嗜酸乳杆菌等调理肠胃菌群。吃药需要在医生的指导下进行用药，以免病情恶化，出现不良反应，对身体健康造成一定威胁。
日常生活中，应当注意饮食方面可以多吃新鲜的蔬菜、水果，帮助适当补充维生素C、维生素E。
经检查，霉菌性食管炎应得到良好治疗，正是霉菌感染引起的食管炎症的表达可以通过活性抗霉菌药物得到有效改善。然而，应注意饮食中少吃腌制食品，以免加重霉菌感染。同时，可以用药物来保护胃粘膜，效果会更好。
胃镜检查要空腹，具体如下：
通常把通过胃镜能顺次地、清晰地观察食管、胃、十二指肠球部甚至降部的黏膜状态，而且可以进行活体的病理学和细胞学检查的过程称胃镜检查。一般胃镜检查前一晚应禁食禁水，以免导致胃酸分泌，影响检查结果。
在治疗期间，患者要注意休息，避免过度的劳累，以清淡、易消化的饮食为主，注意营养的丰富均衡。
胃肠镜是两种检查，胃镜费用在300元左右，肠镜费用在600左右。
一般在完善胃镜检查之前，需要患者行心电图检查，以及抽血化验是否存在乙肝、丙肝、梅毒或者艾滋病感染等检验项目，这两类费用是在100-200元左右不等。若完善肠镜检查，还需要喝泻药清洗肠道，泻药的费用一般是在100-200元左右不等，如果患者完善胃镜加肠镜检查的总体费用应该是在800-1000元
一般情况下，霉菌性食道炎如果不进行治疗持续发展，那么可能就会出现霉菌性肠炎。
霉菌性食道炎这种疾病需要及时进行治疗，如果不服用药物是无法自愈的，如果病情比较严重，最好是做详细明确的诊断，然后再对症治疗。该病可能会出现进食困难、吞咽困难等症状，严重危及生命安全。在药物治疗方面，首选抗真菌类药剂，日常要养成良好的饮食习惯，定期去门诊复查。
