多囊卵巢综合症经有效治疗后，大部分都是可以正常怀孕的。临床针对多囊卵巢的治疗方法比较多，比如中西医结合的药物治疗，调理内分泌，增强子宫卵巢功能进行排卵，或通过腹腔镜技术针对多囊卵巢治疗或进行人工卵巢技术治疗等病情康复以后，病人能排出优势卵泡，就可以怀孕生育了。
多囊卵巢可以用中药进行调理。有多囊卵巢的女性，大多月经周期不规律，排卵不正常。不容易自然怀孕。如果平时月经不太规律。要先测一测卵泡，要是也没有优势卵泡。一般要先调理月经周期，再促排卵的。
保守治疗，一般多囊肾处于早期，若出现相关临床症状，可做对症处理，如减少囊液分泌、降低血压或者采用一些结合的药物，来缓解患者的症状；手术治疗，多采用囊肿去顶减压术治疗，即把肾脏囊肿单独打开，降低对周围正常肾组织的压迫，保护正常肾组织的功能。
多囊卵巢不孕症的治疗方法有很多，可以使用药物治疗药物主要是性激素类药物。主要适用于年龄较轻、有生育要求的多囊卵巢不孕的病人，如果已经特别严重的病人，还可以通过手术治疗。
多囊肝由于遗传因素导致，由于基因缺陷引起，会导致肝脏的多发囊性改变。
这种情况多伴有肾脏的多囊现象，所以应该进行肾脏的彩超检查，确定一下肾脏的情况以及进行遗传基因的检查，并且考虑配合中药调理，通过中药调理来延缓多囊肝的进一步的发展有一定的效果，不过效果有限。
这种情况除了进行中药调理，还要进行遗传病学的相关检查以及积极治疗等，还要根据患者的情况定期复查肾脏彩超、肝脏彩超等。患者需要注意的是，平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
多囊卵巢综合症治疗方法主要有药物治疗和手术治疗2种，药物治疗方式主要的疗法如抗雄激素治疗及促排卵治疗。如果治疗效果不佳可以进行腹腔镜手术治疗。中医疗法对多囊卵巢综合症也有一定的治疗作用。