单纯的血清碱性磷酸酶低于正常范围时，不结合其他检查结果不具有代表性，需要结合其他检查结果，共同进行诊断。另外，在重症慢性肾炎，甲状腺功能不全，严重贫血，营养不良，维生素缺乏，坏血病，呆小症等疾病中会出现碱性磷酸酶降低的现象。
肝功能碱性磷酸酶偏低提示有肝胆疾病。
肝功能碱性磷酸酶高值提示胆管梗阻，低值在儿童和孕妇中最常见。高值提示活动性骨沉积的可能性较大，临床上碱性磷酸酶偏低提示胆道系统疾病，慢性肾炎贫血、甲状腺功能不全、碱性磷酸酶偏低在肝病患者中比较少见，碱性磷酸酶偏低在肝病患者中比较少见。建议患者需要引起一定的重视，及时就医做进一步的检查明确诊断，防止病情加重危害到身体健康。
儿童血清碱性磷酸酶高的原因有以下几点：
1.生理因素:儿童正处于生长发育的快速期，碱性磷酸酶是骨代谢的标准。在骨骼生长的过程中，碱性磷酸酶的含量会比较高，然后血清碱性磷酸酶会升高；
2.病理因素:如缺钙时，血清中的碱性磷酸酶会升高，同时会表现出低出血钙、高血磷的现象。还有一些情况是肝细胞功能受损或肝细胞坏死，也可表现为碱性磷酸酶升高。另外，如果碱性磷酸酶明显升高，也要注意恶性肿瘤的可能。
血清碱性磷酸酶偏高，可能是胆道系统疾病。比如阻塞性黄疸，胆总管梗阻、胆道肿瘤和胰头癌时，会有碱性磷酸酶升高。完全性阻塞性黄疸，有80%碱性磷酸酶可升高到正常值的五倍左右。还有肝细胞性黄疸，碱性磷酸酶会升高到正常值的3倍左右。骨骼系统疾病也会导致碱性磷酸酶升高，比如软骨症，肢端肥大症，佝偻病。
肝功能碱性相关药物酶偏低也可以见于慢性肾炎贫血、甲状腺功能不全等，碱性相关药物酶偏低在肝病病人种也是比较少见的，因此也需要引起一定的重视。做进一步的检查明确诊断。
碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶高偏高时说明肝脏有损，可以进一步去医院做超声或ct检查，如果服用其他的药物，也有可能会引起药物性肝损害，但是主要是以转氨酶升高为主。