肾结核经过半年至1年左右的抗结核内科药物治疗后，患侧肾脏因为结核而失去功能，由于患侧肾脏因为结核而钙化，包裹，形成结核性脓腔内有结核菌存在，抗结核药物无法到达，因此必须手术切除失去功能的肾脏。
临床表现有持续性咳嗽、咳痰，甚至伴随有咯血、低热、乏力、盗汗等症状，持续2周以上，还可伴随有食欲不振、消瘦、精神萎靡等症状。取呼吸道分泌物、痰液检查或者培养结核杆菌为阳性，PPD试验阳性，双肺X光片或者CT显示有典型的结核病灶存在。
腮腺肿瘤可与鼻咽癌相鉴别诊断，两者均以耳垂下方肿物的症状入院就诊。若病人发现自身耳垂下方存在肿物时，应尽早前往医院的头颈外科或耳鼻咽喉科就诊。通过专科医生的检查，可鉴别病人为鼻咽癌还是腮腺肿瘤，鉴别方法包括超声检查及纤维鼻咽喉镜检查。
陈旧性肺结核是因为肺结核患者在经过治疗以后，在肺内留有的纤维结节样组织，就是疤痕组织，患者病情稳定，不需要特殊处理。需要进行治疗的是活动性肺结核，如果不及时治疗病情会逐渐的进展，甚至会导致全身的播散，或者出现相关的并发症。对于活动性肺结核的治疗，最主要的还是正规的抗结核治疗。
肺结核与NTM肺病的鉴别，可以通过以下方式：NTM肺病也称结核分歧杆菌肺病，虽然临床表现和肺结核比较类似，也会出现咳嗽，咳血，发热等症状，但是NTM肺病常由支气管扩张、肺结核等慢性病发展而来，鉴别时可以通过细菌培养来进一步确定，发现结核分歧杆菌时诊断肺结核，没有发现结核分歧杆菌时，可以诊断为NTM肺病，当然也可以通过病理学的方式来鉴别。
脊柱结核可以与腰椎间盘突出、腰肌劳损等疾病来区分。两者都有腰痛、腰酸等症状，但也有低热、盗汗等感染等现象。腰椎间盘突出以下肢的根性症状为主，无全身征象，血沉、C-反应蛋白低，X线片无骨损害，CT核磁共振可以显示突出髓核，脊柱结核也能与脊椎肿瘤进行鉴别。但两者骨质破坏特征不同，肿瘤容易导致骨质损伤，对椎间隙影响不大。脊椎结核易侵犯椎间隙等软骨组织，如椎体间隙、椎体间隙变窄、椎旁脓肿等。
