常用的治疗方法有外用抗菌药物、口服抗菌药物以及手术治疗等。最常用的可有亮甲等药物，手术的话，可以拔甲治疗。脚趾灰指甲是脚癣的一种，主要是毛癣菌感染所致，是其真菌的一种，临床表现为指甲变厚、变灰、表现凹凸不平等症状。
甲癣通常是由真菌感染引起的。它以相对较快的速度发展，易于交叉感染。皮肤和指甲变黄，变脆，容易脱落。治疗甲癣的常用药物需要用很长时间，需要2到3个月。也可以用米醋每天浸泡脚两次，每次大约半小时。平时要穿更舒适的鞋子。
灰指甲是由于真菌感染引起的，如果小孩子得了灰指甲，应该尽量把坏指甲都剪掉，带宝宝去当地正规医院皮肤科就诊，平时注意宝宝个人卫生，保持干燥，用醋泡患部。注意清淡饮食。
轻微的灰指甲应该属于甲损伤不严重，主要有可能会出现有轻微的变色，是由于真菌感染引起的，如果不治疗就会严重，常用的方法包括用小利刀刮除松脆病甲，或挫薄增厚的病甲，然后涂碘酒或冰醋酸溶液，也可把病甲浸于碘酒或鹅掌风特效药中，坚持治疗几个月后，即可生出新甲。
小孩灰指甲是由真菌感染引起的，是由指甲与甲小皮的连接处引起的。小孩灰指甲一般不适合治疗，因为服用治疗灰指甲的药物会对肝脏造成一定的刺激，如果给小孩服用了，会影响到小孩的成长和身体健康，可以使用硝酸舍他康唑乳膏或足光散浸泡脚部，这样可以起到一定的抑制作用。当小孩年龄超过16岁时，可以服用特比萘芬片或伊曲康唑片，持续服用3-6个月后，灰指甲的变化就会消失。
