常有发热、头痛等前驱症状。发病时主要表现为精神行为异常、认知功能障碍、近事记忆力下降、急性或亚急性癫痫发作、语言功能障碍、运动障碍、不自主运动、自主神经功能障碍以及不同程度的意识障碍甚至昏迷等。还可出现睡眠障碍，主要表现为嗜睡、睡眠觉醒周期紊乱和白天过度睡眠等。
免疫性血小板减少性紫癜早期可能无症状或仅表现为皮肤紫癜，后期会出现肝、脾肿大、腹水、黄疸。外周血小板显著减少，骨髓巨核细胞发育成熟障碍，皮肤粘膜或内脏出血，严重的会出现关节疼痛或鼻出血、牙龈渗血、妇女月经量过多、腹痛便血、吐血、尿血的症状。
在疾病早期自身免疫性肝炎病人很多没有临床不适症状，随着疾病的进展，部分病人会出现乏力、关节痛、皮肤巩膜黄染等，在疾病后期，严重者会因为肝硬化、食管胃底静脉曲张等并发症的出现甚至出现呕血等危及生命的情况。
病情严重者可能遗留癫痫及认知功能障碍等。脑炎全身毒血症状有发热、头痛、身痛、恶心、呕吐、乏力。少数有出血疹及心肌炎表现。神经系统症状表现为意识障碍，脑膜刺激征。可出现颈肌及肩胛肌弛缓性瘫痪，以致头下垂及手臂不能上举，摇摇无依。脑神经及下肢受累少见。瘫痪2～3周可恢复，约半数肌肉萎缩。轻症可无明显神经症状。
免疫性肝损伤的症状对一些有合并伤的肝脏外伤病人，如脑外伤神志不清，多发性骨折伴休克，年老体弱反应迟钝者要提高警惕，以免产生漏诊，肝硬化或肝癌病人轻度外伤即可引起肝破裂，不可掉以轻心，药物性肝损伤可见肝炎表现，而药物诱导的自身免疫性肝炎病人除肝炎的症状外，还可有发热、皮疹、关节疼痛等肝外表现，血清中可检测到较高水平的丙种球蛋白和自身抗体。
人工授精就是在监测到女方有排卵和卵泡发育成熟要排卵的时候，男方的精液注射到女方的阴道宫颈旁边进行受孕，但是如果有免疫性不用的时候，这样的操作过程仍然不能让精子跟卵子结合。免疫性不孕需要用药治疗后才可怀孕。
