通常来讲，小儿肠胃炎不一定要吃抗生素，首先要确定病因。若小儿肠胃炎属于病毒感染，不需要使用抗生素。儿童因细菌感染导致的胃肠炎，出现腹痛、腹泻、恶心呕吐等症状时，可以口服头孢克肟等头孢类抗生素，也可以口服阿莫西林等青霉素类抗生素。如果出现严重的腹泻，可以服用蒙脱石散等止泻药。此外，避免药物对胃肠道粘膜的刺激，可在饭后服用。
细菌性肠炎在正常使用抗生素的情况下是不会导致小孩身体健康的。并且可以缩短病程减轻小孩，因为常肠炎腹泻导致的营养不良，及生长发育，抗生素会有一定的副作用，但很小。去医院开相关药物，病情基本可以康复，而且可以防止小孩因，腹泻导致营养不良。
宝宝本身是有一定的自愈能力的，不一定要吃抗生素。平时注意营养要均衡，多吃些水果蔬菜。饮食上少吃辛辣，刺激性或者油腻的食物。然后观察一段时间，如果不见好转就需要使用抗生素，或者去医院治疗。
一般情况下，急性胃肠炎可用以下几种抗生素进行治疗。
患者首先得先检查是否有幽门螺杆菌的感染，如果检查结果显示患者感染指标较高，可使用克拉霉素或阿莫西林，配合奥美拉唑或奥硝唑进行治疗。另外，还可以选择两联抗生素进行治疗，比如克拉霉素配合左氧氟沙星。如果是因大肠杆菌感染导致的急性肠炎，可使用相应的广谱抗生素，如果是因痢疾杆菌感染导致的，则使用左氧氟沙星、头孢类药物进行治疗。
直肠炎比较严重的，需要口服抗生素辅助治疗，医生根据的实开具中药药方，服用中药汤剂治疗。肠炎一定要注意饮食调节。不能够吃辛辣刺激生冷的食物，要以清淡饮食为主，尤其是要多吃蔬菜水果。
婴儿肠炎用抗生素的时间要依据病情而定。要用至孩子临床症状消失，炎症反应指标恢复正常为止，跟疾病的轻重，感染致病菌的毒力等有关。小孩子应用抗菌素要慎重，要有明确的细菌感染的指征。要按照细菌培养的结果选择敏感的抗菌素，病情好转后尽快停药。