目前主要有西药治疗、手术治疗和中医治疗技术等，药物治疗主要目的是抑制雌激素合成，使异位种植的子宫内膜萎缩，或切断下丘脑-垂体-卵巢轴的刺激和出血周期，但对于较大的巧克力囊肿，不宜采用性激素治疗，腹腔镜是目前手术治疗内异症的主要手段。
治疗子宫腺肌病患者可以口服一些镇痛的药，比如消炎药，比如芬必得。还可以使用激素类药物，例如：雄激素类衍生物、促性腺激素释放激动剂、曼月乐等。
这是一种伪绝经治疗，对于治疗月经多和轻度的疼痛比较有效，严重的时候会出现一些不良反应。子宫腺肌病有两种类型：根治性和保守性外科。根治的方法是彻底的把子宫切除干净，干净。对于没有生殖需求，病灶范围大，病情较重，经保守疗法无效的病人。目前主要采用子宫肌层切除术、子宫内膜及肌层切除术等保守治疗方法。该产品用于需要生殖的病人。女性来医院的时候最好是在女性来例假之后3-7日，如果有怀孕的需求，在4-7天内可以进行试孕期。
治疗子宫腺肌病的主要措施有以下：
1、药物治疗：对没有生殖需求的病人，可采用药物治疗的方法来治疗子宫腺肌病，也可以通过防止宫内节育器进行治疗，例如曼乐环；
2、手术治疗：子宫腺肌病可以通过宫腔镜和宫腔镜下的手术治疗；
3、聚焦超声：聚焦超声实际将超声波集中在腺肌病的病变处，将其加热到65摄氏度或更高的程度，从而导致病变区域的凝固坏死。聚焦超声也可以用来治疗子宫腺肌病。
子宫腺肌症的发病通常与瘀血、痰湿、热邪、气虚、肾虚等因素有关，治疗应以祛邪扶正为主。因此，子宫腺肌症的中药治疗方法包括口服中药、局部药物外敷、药物灌肠、阴道给药等。
1、口服中药，多以辨证治疗为主；
2、局部药物外敷，可直达病灶；
3、药物灌肠，可缓解肠胃不适感；
4、阴道给药。
中药多采用综合治疗的方式，需注意保暖不贪凉、饮食节制、保持气机通畅来帮助缩短治疗周期。
如果患了单侧巧克力囊肿，可以选择在女性排卵期前后同房，可以增加怀孕的几率。患者应该去正规医院的妇产科检查，根据检查的结果对症治疗。平常应当注意休息，避免劳累过度，避免重体力劳动，可以多吃新鲜的蔬菜和应季的水果，忌食生冷辛辣刺激性的食物，少吃寒凉生冷的食物。保持轻松愉悦的心情，缓解压力，注意保证充分的休息和充足的睡眠。可以适当运动，提高身体的免疫力。
