卵巢囊肿影响激素平衡会发生月经紊乱，与疾病严重情况有一定关系。但是当女性体内激素发生异常时，会影响到月经。因为卵巢囊肿与内分泌机能失调促黄体素分泌不足排卵机能受到破坏有关，所以卵巢囊肿会对月经有所影响。
有的可能是生理性的，也有的是病理性的。这与自身的发病原因是有一定的关系的，具体每个人的发病原因及病情程度不一样，对身体的伤害也是不同的。患有此病的话，一般都会引起月经的异常改变。
是会引起月经不调的，巧克力囊肿的症状常见的有痛经、下腹痛、经期发热等多种，作为子宫内膜异位症的一种，巧克力囊肿除了含有子宫内膜异位症的症状外，还具有自己特定的症状。饮食宜清淡，不宜常食刺激性、海产品等。
附件囊肿会影响月经，宫颈囊肿不影响月经，因为宫颈囊肿是慢性宫颈炎的一种，一般无明显症状，而慢性宫颈炎的主要症状是白带增多，由于病原菌的不同，白带的颜色、量也有所不同。白带可为粘稠的或脓性的，有时可带有血丝或少量血液，也可有接触性出血。下腹或腰骶经常出现疼痛，盆腔部可发生下坠痛或痛经，常于月经期、排便或性交时加重，此外，可出现月经不调和不孕。
纳氏囊肿一般不会影响月经。
宫颈纳氏囊肿即宫颈腺体囊肿，是一种慢性宫颈炎。囊肿通常不用治疗，每年检查即可；密集较小的纳氏囊肿或大的囊肿，可以进行物理治疗，如光疗、激光、微波、自凝刀等；较大突出于宫颈表面的可以用电刀切除。其病因慢性炎症刺激，宫颈组织反复充血、水肿，炎性细胞浸润，结缔组织增生导致的子宫颈肥大，严重的可以增大1倍以上。充血、水肿在炎症消失后减轻或消退，因纤维化，宫颈被覆鳞状上皮全部覆盖，表面光滑，体积仍然较大；宫颈腺囊肿保持突出的外形。周围组织挤压腺管，导致腺口阻塞，分泌物无法外流潴留于内，导致腺腔扩张，形成囊形肿物，即子宫颈腺潴留囊肿。它的粘液清澈透明，可能合并感染呈混浊脓性。
卵巢囊肿会影响来月经。
卵巢囊肿是一种女性生殖器官常见肿瘤，会影响到女性的月经功能，多表现为功能性子宫出血，以及不规则月经并伴有痛经，部分患者还会出现闭经的情况。所以卵巢囊肿会影响来月经。临床上对于小于五厘米的卵巢囊肿一般通过服用中药金鸡胶囊、桂枝茯苓胶囊来治疗。如果卵巢囊肿大于五厘米，则需要进行手术切除。
