输尿管结石微创手术方法，在输尿管尿道口尿道进入膀胱，然后沿着输尿管口插入导尿管中，直至输尿管结石的位置，在输尿管镜的指使下沿着通道插入钬激光光纤或者气压弹道设备，将结石打碎取出。
输尿管结石微创手术方法包括输尿管镜和经皮肾镜手术。输尿管镜手术，通过输尿管软镜技术将输尿管或肾中结石取出，不适用于较大的结石；经皮肾镜手术，从腰上肾的部位打一个小孔，直到结石部位，通过特殊的器械和方法，把结石打碎，从小孔取出。体外冲击波碎石，又称微波碎石或震波碎石，是较常用的方法，具有花费小、损伤小、恢复快和费用低等优点。
输尿管结石手术的治疗费用与结石的大小、治疗方法以及就诊医院级别、医院设备等有关。例如体外冲击波碎石在三甲医院一次是1000元左右，输尿管镜下碎石有钬激光碎石、超声碎石，碎石方法不一样，的收费标准也不一样，因此并不能确定具体的手术费用。
输尿管结石治疗方法要据病人的具体情况而决定。若结石体积较小、存在时间的短，输尿管及膀胱无梗阻、采取保守治疗便可将结石排出，如药物治疗、多饮水及适当运动等。而需手术治疗输尿管结石的适应症如下：输尿管、尿道或膀胱存在畸形或狭窄，即便结石体积小也需要手术治疗。
输尿管结石手术，常见的就是输尿管镜钬激光碎石、输尿管切开取石、腹腔镜切开取石以及经皮肾镜手术碎石取石，这些手术都需要麻醉，手术后都需要留置DJ管在输尿管内支撑，所以这些手术后患者不能有效的排尿，所以必须要留置尿管。