当患者在早晨醒来时发现尿液中含有很多结晶颗粒，就说明结石已经进入了体内。也许会跟随起床后某项动作，特别是体位改变，从平卧至坐起至站立体位改变，会使结石在肾脏内运动移位。此时结石与肾盂黏膜摩擦损伤接触，此种情况可导致出血和血尿的发生。还有一种情况就是出现急性尿路感染。还可导致腰痛，这类腰痛通常都不太厉害，可表现为一过性短时间发作胀痛、钝痛或酸疼。
在平时要注意观察身体上有没有结石。若平时均发作，影响起居，结石较多，可采用体外碎石或微创手术等方法。
可能是受风寒，或者是腰椎病引起的。需要做腰部的检查的。也可能受到外伤拉伤，扭伤引起的疼痛，可以适当的吃止疼药缓解。如果是缺钙引起的，就要补钙。适当的热敷按摩也可能会好转的。
可能与睡眠姿势不舒适有关系，应该是腰肌劳损，不可以久坐或者久站，多注意休息，减少腰部受力，不要干重体力活动，可适当贴膏药进行缓解，平时不要弯腰劳动，适当休息，做按摩或者理疗。
可能是睡觉时腰椎姿势不对引起的，也可能是夜间休息时腰部受到寒冷刺激引起的，可导致腰部肌肉出现损伤，而出现急性的腰部疼痛，活动受限。夜间睡觉时，床垫太软。可诱发椎间盘突出急性发作，可出现腰部及腿部疼痛不适。
早上起来腰疼可能与睡眠姿势不对关系。比如床铺过软过硬的。也可能与腰部疾病有关系，比如腰部肌肉韧带劳损等。也可能与肾脏疾病有关系。可以做腰部核磁检查，泌尿系彩超检查，肾脏CT检查等。查找病因，对症治疗，生活中注意调养。