一般情况下，小儿原发性脑干损伤要做的检查有：颅脑CT和MRI检查、脑干听觉诱发电位检查和X线检查等。具体内容如下：
1.颅脑CT和MRI检查：小儿原发性脑干损伤要做颅脑CT和MRI检查，可以检查出脑干部位的挫伤及肿胀变化。
2.脑干听觉诱发电位检查：小儿原发性脑干损伤要做脑干听觉诱发电位检查，通过波形的波幅和潜伏期可以较准确地反映脑干损伤的平面及程度。
3.X线检查：小儿原发性脑干损伤要做X线检查，以便明确后颅窝骨折、高位颈椎骨折的情况，有助于脑干损伤的诊断。
一般情况下，小儿原发性脑干损伤可能是外伤、颈椎病变等原因引起的。
1、外伤：由坠落伤或较重的挤压、撞击伤所致，头部的钝性暴力可导致脑干直接撞击天幕游离缘，引起脑干挫伤、牵拉和扭转。
2、颈椎病变：小儿原发性脑干损伤可能是颈椎过伸或过屈导致下脑干或上颈髓的部分或完全撕裂伤导致的。
这个疾病多数情况下是不需要手术治疗的，维持生命体征的平稳，内环境的稳定，减轻脑细胞的水肿，可以使用强力的脱水药物来进行治疗。
原发性脑干损伤可通过创伤引起头部撞击，可导致脑干撞击颅骨板，或导致脑干损伤的脑组织运动或扭曲；或导致颅骨压缩、严重变形或脑室内脑脊液IMP的头部损伤。导致导水管周围或第四脑室底部受伤的行为。原发性脑干损伤常伴有弥漫性脑半球损伤。在严重的病例中，手术是必要的，晚期康复也很重要。
脑干损伤后遗症的表现，主要是看患者损伤哪个部位的脑干，如果是损伤延髓部位的脑干，患者就有可能会留下吞咽困难，饮水呛咳，一侧肢感觉减退，甚至眩晕、恶心、呕吐等后遗症。如果是损伤脑桥部位的脑干，可能会留下口角歪斜、视物模糊、眼球活动受限等后遗症。
脑干损伤后遗症的表现，主要是看患者损伤哪个部位的脑干，如果是损伤延髓部位的脑干，患者就有可能会留下吞咽困难，饮水呛咳，一侧肢感觉减退，甚至眩晕、恶心、呕吐等后遗症。如果是损伤脑桥部位的脑干，可能会留下口角歪斜、视物模糊、眼球活动受限等后遗症。如果是损伤脑干的中脑部位，患者可能会留下肢体偏瘫，甚至肢体震颤及肢体不协调等症状。
原发性脑于损伤在颅脑损伤中占有较大的比重，通常指暴力作用于枕部引起脑干为主的损伤，并于伤后立即发生持续时间较长的意识丧失或死亡。暴力作用于头部造成的原发性脑干损伤约占颅脑损伤的2%~5%，在重型颅脑损伤中占10%--20%。脑干内除了颅神经核。