肛周脓肿和肛瘘属于开放性的伤口，一般不做缝合，每天换药，坐浴熏洗，就能做到不感染。至于复发，和疾病和做手术有关。应该注意局部清洁卫生。防止伤口受压，尤其在睡觉时避免压倒患处。在手术后2-3天内可以吃一些流食，之后可以进食无渣或少渣的食物等。另外，手术后也就是第五天后应该注意多吃蔬菜、水果。特别注意的是不要进食辛辣刺激的食物，禁烟酒。
肛周脓肿是因直肠炎症等蔓延到周围形成是一个浓腔，脓液较少时可以通过大剂量的消炎药治疗，但脓液较多时应该要切开引流，肛周脓肿如果不及时处理，浓腔破溃后就发展形成肛瘘，肛瘘治疗就相对复杂了，所以建议在医生的指导下消炎治疗，如果浓液太多没法控制，要尽快切开引流。
手术后要生活规律，注意休息，清淡饮食，避免烟酒刺激，多吃蔬菜和水果，避免油腻辛辣刺激性食物，可以多吃蔬菜和粗粮，忌海鲜牛羊肉等发物。要注意多喝水，保持大便的通畅。
脓肿形成初期可行保守治疗包括应用针对需氧菌和灭氧菌的抗生素中药清热解毒等。脓肿一旦形成即行切开引流。脓肿大且全身症状重者除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外尚需辅以支持对症治疗。
患有内痔，肛周脓肿轻症状时可以保守治疗，严重症状时必须手术治疗，手术一般在半个月做月左右就能恢复。每天用生理盐水清洗肛门，温水坐浴。注意饮食多喝水，多吃蔬菜水果，少吃辛辣的食物。
需要行手术治疗，术后予适当的止痛，使用预防性使用抗生素。一般不常规使用抗生素，大部分经过手术治疗就能够获得痊愈，短期内即可恢复正常生活，也有个别会复发。如果浅表脓肿仅需局部麻醉。一般是可以在门诊进行手术的。