畸形的精子根本不会和卵子结合，精子畸形是可能影响受孕率的，对胎儿的发育影响不大，一般畸形精子受孕的几率是很小的，只要做好了孕期的检查像B超，彩超，唐氏筛查等，如果有异常应该是可以检查出来的。在怀孕前做好治疗，以免对胎儿有影响。建议选择到正规专业的不孕症专科医院做详细检查，针对治疗。
CT检查实际就是接触X射线，如果怀孕了，孕期接触X射线可能会引起胎儿畸形.，对精子没有损害，精子整个的发育周期是3个月左右；成熟精子在体内存活的时间一般是2周左右，受到照射的这部分成熟精子，最多两周之后便没有了；不成熟的精子，如果受到照射，大多无法发育成熟。没有太大的影响。
精子畸形不会导致胎儿畸形，胎儿畸形与精子畸形不是一回事。精子畸形只是形状不正常，影响受精能力，精子内在质量才是影响胚胎质量和流产的主要因素。单纯精子畸形率高不会导致流产率和胎儿畸形率升高，但是部分畸形精子症患者存在精子DNA碎片率高、染色体异常等疾病，才会造成流产率和胎儿畸形率升高。
正常男性也是有一定的精子畸形，如果出现男性精子的畸形率高具体是指正常形态的精子少于50%，即精液中畸形精子超过50%。而且男性的内分泌功能出现了异常情况导致了某些相关激素的分泌不平衡，这样一来也是会导致男性精子质量下降的，从而造成畸形效果增高。引起男性精子畸形的原因有泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等，们均可影响男性精子的质量。
及早到正规医院详细的检查，明确病因后做针对性的治疗。精子畸形可造成男性不育症和妇女习惯性流产等。畸形精子如超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，则治疗困难。
精子畸形率越高，导致许多男性不育的可能性也越高，意味着受孕机率的降低，但与胎儿畸形并无明确相关性，畸形精子症并不一定会导致胎儿畸形。因为女性生殖道有优胜劣汰的功能，精子在穿过女性生殖道的过程中会将大部分畸形精子淘汰掉，从而排除了畸形精子和卵子结合的可能，最终保证受孕的精子的质量。