新生儿黄疸照蓝光有副作用，但是副作用多不严重，是很轻微的，不影响继续照蓝光。蓝光照射的副作用可以有发烧、腹泻和皮疹，因为蓝光可以分解体内的核黄素，如果蓝光照射时间超过24小时，可以引起核黄素的缺乏，所以光疗的时候要补充核黄素。
可出现发烧、腹泻和皮疹，但多不严重，可继续光疗，光疗可分解体内的核黄素，光疗超过24小时，可引起核黄素减少，进而加重溶血，所以宝宝在用光疗的时候要补充核黄素。如果直接胆红素升高，光疗可使皮肤呈现青铜色，即青铜症，可以自行消退。
蓝光可以使孩子体内的非结合胆红素，转换成可以水溶性的胆红素，不需要经过肝脏处理，从而经过胆汁和尿液排出。蓝光治疗也有一定的副作用，如低热、皮疹、腹泻，少数可能出现暂时性血小板减少。
蓝光治疗新生儿黄疸是有副作用的，主要是对皮肤的危害较大，容易引起发热、皮肤灼伤、皮肤脱水、钙缺乏和维生素B2的缺乏。所以在治疗的过程中一定注意保护皮肤，适量添加钙剂和维生素B2，多补充体液。
红蓝光祛痘是有效果的，且效果维持时间较长，患者可以放心地选择红蓝光祛痘治疗。
红蓝光祛痘是利用高纯度、高功率密度的红光及蓝光，直接作用于长痘的皮肤，消灭皮肤中的细菌，促进皮下胶原弹性蛋白新生。此方法安全、有效，且效果可以长期维持。在祛痘的同时，还可以改善细小皱纹，提亮肤色。
需要注意的是，光敏体质、妊娠及哺乳期妇女不能进行红蓝光祛痘。
蓝光疗法具有低的不良反应，是比较安全的。蓝光疗法有：低烧、皮疹、腹泻、核黄素不足等不良反应。会造成不明显的水分流失，在照射时要多饮水。没有蓝光照射后，疹子就会消失。
腹泻是由于胆红素在肠道中的排出，从而促进了肠道的蠕动，从而导致了大便的频率升高。在进行蓝光治疗时，会损伤到体内的核黄素，需要给予一定的剂量。