肛周脓肿切开排脓术后会形成肛瘘，但是几率非常的小，如果是去正规公立三甲及以上医院的肛肠科进行的手术，则效果更好一些，而且术后需要注意不要吃辛辣刺激性的食物，养成定时排便的习惯，避免大便干燥。
肛周脓肿切开排脓是会痛的，不过会有麻醉的，是不会感觉到痛的。随着脓液排出，疼痛也逐渐缓解，最后炎症完全消退。病情较轻时，脓液可以自然流出。肛周脓肿多数情况下会有疼痛剧烈，需要切开引流。除非病情很轻，病灶一般都一天比一天扩大，因此应尽早切开排脓。
肛周脓肿切开排脓后应该积极地进行手术，一般的肛周脓肿需要切除，按时换药，促进伤口愈合。一定要及时手术治疗，时间久了，肛周脓肿会自然形成肛瘘。肛周脓肿切开排脓后是否需要二次手术主要是看后期是否形成肛瘘，如果没有形成肛瘘则无需再次手术。
一两天就可以进行手术。其实切开排脓就是手术，脓肿就是切开引流脓液这么治疗，是否需要二次缝合，要看术后恢复情况。如果脓液引流的干净，彻底充分，不需要特别处理，伤口能自己长上。
大概在几天的时间，首先在局部用碘酒，酒精消毒。脓肿破溃口如果过小，首先将破溃口延长，达到充分引流的目的。用手指或止血钳深入脓腔内，分离脓腔内的间隔，将脓液引出。
肛周脓肿是发生于肛周组织的感染性疾病，肛周脓肿一般是行切开引流术，大多数肛周脓肿在切开排脓后，症状就会好转的，除非又继发感染，否则是不需要二次手术的，手术后每天需清洗伤口或做盆浴。