治疗口腔溃疡主要是使用促进愈合的药物，并且防止继发感染。可以使用消炎药物涂抹于溃疡病损区。并且还要注意提高自身的免疫力，提高抗病毒感染的能力。这样能使患处尽快的恢复。
口腔溃疡是体内缺少维生素的原因造成的，多吃含有维生素C和维生素B的食物，比如，橙子、橘子、猕猴桃，南瓜等。平时可以吃些水果跟蔬菜。保持营养的均衡。不要吃上火的东西要多喝水，少熬夜。
虽然以口舌生疮的方式表现，但病因很多，在十四五天的样子左右会自我愈合，所以很多情况下不需要治疗，但是对于有些病者症状很疼痛，所以需要进行对症治疗。使用局部的漱口水，可以很好的缓解症状。良好的生活方式，多吃蔬菜、水果，保证睡眠时间需要充足，减少不佳日常生活与作息习惯。
临床所见口腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食、语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。其治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。
口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
