蓝光治疗新生儿黄疸是有副作用的，主要是对皮肤的危害较大，容易引起发热、皮肤灼伤、皮肤脱水、钙缺乏和维生素B2的缺乏。所以在治疗的过程中一定注意保护皮肤，适量添加钙剂和维生素B2，多补充体液。
新生儿黄疸蓝光治疗时需要注意以下事项：
第一，最大限度的暴露在蓝光下，除了眼睛和外阴部分，其余部位都要暴露。第二，要注意保护眼睛，用一块不透光的布遮住眼睛。第三，要注意生殖器官的保护。第四，要有距离，建议保持40公分和20公分的间隔。如果太远的话，效果不好，太近了，会对皮肤造成伤害。第五，要注意身体的温度，因为在蓝色的光线下，会产生热量，而且会使体温上升。第六，要注意补水。
新生儿黄疸蓝光治疗费用大概在80至100元一天，如果新出生一周内的宝宝，只有黄疸没有其他症状，一周的住院费用在1200至2000左右。具体准确的费用是要根据医院的等级和所在的城市而定。如果是生理性的黄疸就不需要做蓝光治疗。
蓝光是治疗新生儿黄疸非常普遍的一种方法，其效果是比较好的，蓝光治疗的目的是使血液中间接胆红素氧化分解为无毒的水溶性衍生物，从汗、尿中排出，防止发生胆红素脑病。
蓝光疗法具有低的不良反应，是比较安全的。蓝光疗法有：低烧、皮疹、腹泻、核黄素不足等不良反应。会造成不明显的水分流失，在照射时要多饮水。没有蓝光照射后，疹子就会消失。
腹泻是由于胆红素在肠道中的排出，从而促进了肠道的蠕动，从而导致了大便的频率升高。在进行蓝光治疗时，会损伤到体内的核黄素，需要给予一定的剂量。
在治疗新生儿黄疸的时候要注意以下几点：
1、注意保护眼睛，皮肤，外生殖器，避免光疗法的伤害。
2、在光疗的时候要注意孩子的体温、黄疸的消退情况、皮疹、青铜症等情况。
3、注意喂养，保证充足的牛奶。
4、如果黄疸持续时间比较长，可能是乳汁性黄疸，可以暂停哺乳3天，观察黄疸的消失。
患者在平时应少吃辛辣刺激的食物，保持充足的睡眠，少熬夜。