扁桃体结石是不会癌变，是上皮过度角化的疾病。扁桃体结石是扁桃体的一个慢性疾病，同时可伴有其他咽喉部黏膜的结石。扁桃体结石，主要是由于扁桃体的急、慢性炎症，导致扁桃体隐窝处的上皮过度角化，局部所形成的一种尖锐的沙粒状物，附着在扁桃体表面。
扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，因为此处长期阻塞、分泌物引流不畅而成干酪样物积聚，加上不易溶解的钙、镁等无机盐沉积而成结石，其核心可为小异物、脱落的上皮细胞或细菌等。
扁桃体结石是由扁桃体上隐窝长期阻塞，致使分泌物引流受限引起。极少数的扁桃体结石会自行脱落，大多数还是需要通过外来器械，摘除结石。如果张嘴就可以明显看到扁桃体结石，可以使用镊子夹取出来。
可以到诊所检查，能够直接看到扁桃体的结石，再有就是扁桃体结石，如果长大到一定程度，局部会有一定的异物感。扁桃体结石主要是因为扁桃体的慢性炎症刺激造成的，在有慢性扁桃体炎的时候，因为扁桃体的隐窝有细菌滋生，在进食的时候，一些食物的残渣会残留在扁桃体的隐窝，被大量的细菌包裹之后，形成这种黄白色的团块样的分泌物，也就是常说的扁桃体结石。随着体积的增大，会被咳出口腔，还会伴有一定程度的臭味。
扁桃体结石的形成是由于扁桃体长期慢性炎症刺激，纤维组织粘连，隐窝口炎症或脱落上皮、菌落阻塞，形成潴留囊肿，扁桃体分泌物中钙盐沉积和组织钙化形成结石。扁桃体结石是一种罕见的营养不良性钙盐沉积。