一般来说，甲状腺囊肿能治好。
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。一般情况下，甲状腺囊肿属于良性病变，通常能治好。如果囊肿肿大不影响到颈部外观，或者压迫其他的器官和喉返神经，观察即可；如果特别大，影响美观，或造成身体不适，可以进行囊肿摘除术。
患者在日常生活中应当加强身体锻炼，注意保暖，饮食清淡，不吃刺激性食物多，吃富含钙质的食物，不要吃刺激和油腻的食物。
甲状腺囊肿的危害主要与囊肿的大小有关，小的囊肿并不会造成危害，但是囊肿比较大的时候可能会引起颈部不适，甚至压迫气管和食道，出现吞咽困难、呼吸困难等症状，所以甲状腺囊肿的主要危害在于压迫症状，同时也有可能继发感染破裂或癌变。所以甲状腺囊肿的危害比较大，小囊肿定期检查不会有太大的问题，如果囊肿比较大，可以做甲状腺手术、硬化或者射频消融等治疗。
甲状腺囊肿属于良性疾病，当囊肿较小时，对人体的身体健康没有影响，一般不需要特殊治疗，定期进行甲状腺彩超，甲状腺功能检查等随访。如果囊肿持续增大，出现压迫症状，或者疑有癌变，应择期慎重考虑手术治疗，术后长期以甲状腺激素替代。
甲状腺囊肿形成的原因：
1、甲状腺腺瘤改变是由于瘤体缺血液化形成囊肿；
2、原发性囊肿是甲状腺腺体退化，多见于老年患者，属良性病变。如果不影响外观或压迫周围器官，就不需要做手术。甲状腺结节分为恶性结节和良性结节，恶性结节一般为实质性结节，边界不清、血流丰富、内部有钙化的囊性结节很可能为良性结节，内部无血流或钙化。
甲状腺囊肿可看内分泌科。甲状腺囊肿多为良性病变，行甲状腺超声可发现局部形态规则无回声区，边界非常清晰，内透声良好。如有出血性囊肿，多数患者有外伤史。
甲状腺囊肿多由甲状腺肿结节或腺瘤退行性改变形成。多数患者甲状腺激素水平正常，核素扫描可能提示冷结节。如果是直径大于3cm的甲状腺囊肿，可考虑穿刺抽取治疗。具体的治疗方案还需要根本检查结果来定。
甲状腺囊肿是发生在甲状腺组织的液体囊性肿瘤，若甲状腺囊肿较小，患者可无任何症状处理的较大，如2-6cm，有压迫症状，外观明显肿块，需治疗。
甲状腺囊肿主要治疗手术，结节小时可穿刺吸出液体，注入无水酒精，或进行射频治疗、消融治疗。大多数患者需用手术治疗，尤其是大囊肿。甲状腺囊肿一般不会自行消退，有时略有缩小，里面的液体可以自行吸收，少数变小，但不能完全消除。患者在治疗上主要治疗手术，尤其是合并暴发性增大病史或合并囊内出血的患者需治疗手术。