亚急性甲状腺炎患者在进行治疗时，需要引起重视，亚急性甲状腺炎可表现为共同症状，分别为发热、甲状腺肿大、颈部疼痛等。这些症状都是由于甲状腺功能失调所致，要针对病人的病症对症下药。
如果亚急性甲状腺机能亢进的患者出现了这些症状，就应该及时到医院检查诊断并给予针对性的药物治疗。以及亚急性甲状腺炎病人，很可能起病时症状较轻微，不需要止疼药之类的对症治疗。而且一些病人很可能在发病时症状更加严重，就是要采取相应的措施。如果没有及时采取针对性的措施，那么病情就容易加重或者导致病情恶化。如将需止疼和减慢心率的对症支持治疗，一旦症状较重时，相应治疗时间亦随之增加。
亚急性甲状腺炎以消炎止痛为目的，常使用非甾体消炎止痛药。若应用这类药物止痛无效，可在短时间内应用激素镇痛。
少数亚甲炎患者可伴有严重高代谢症状、心悸、怕热等，其表现非常明显，对这部分病人可在短期内应用β-受体阻断药控制上述高代谢症状。有些亚甲炎病人可并发甲减严重，病人可出现畏寒、乏力等变化，对这部分病人可短期用小剂量左甲状腺素钠片代替治疗，但不必长期服药。
亚急性甲状腺炎预后良好，病人不必有过多心理负担。
如果是亚急性甲状腺炎，严重疼痛时可以使用非甾体类消炎药来止痛，亚急性甲状腺炎患者服用非甾体消炎药，并不一定能立即缓解疼痛。
部分患者服用非甾体类消炎药后，可能会出现颈部疼痛加重的情况。这时候可以适当使用激素类药物，使用激素类药物治疗后，患者的疼痛症状能够得到有效的控制，同时还可以控制发热，血沉增快的情况，但是需要逐渐减少用量，避免产生依赖性。
亚急性甲状腺炎如果症状轻只需口服药物治疗即可，如果症状重颈部疼痛发热明显，就需要激素治疗，一般需要2周以上可以考虑减药。减药应慢，减药快易复发，需要在医生指导下根据辅助检查用药。
亚急性甲状腺炎有多种治疗措施，临床治疗通常是使用抗炎药、退烧药，若发热持续不退则需要使用糖皮质激素进行治疗，但在进行激素治疗前应评价患者是否适合激素治疗。具体治疗措施应由医生面诊后，根据患者情况给出详细的治疗方案。
急性甲状腺炎是由细菌、病毒、真菌等感染引起的急性化脓性炎症。治疗上要支持治疗，加强营养，注意休息，高热要进行补液和降温治疗，同时经验性进行抗生素治疗，穿刺病原体，穿刺物进行菌培养和药物敏感性试验，根据药物敏感性试验结果选择抗生素抗炎治疗。
急性甲状腺炎合并基础性疾病或免疫缺陷的患者，需要抗炎疗程长，抗炎疗程2-3周。同时治疗基础性疾病，提高机体抵抗力，促进急性甲状腺炎的愈合速度，甲状腺脓肿形成需行手术切开脓肿排脓治疗。检查发现梨状疮孔导管形成患者，手术切除疮孔导管，防止感染复发。