前者最常用于治疗水痘带状疱疹及Ⅰ型、Ⅱ型单纯疱疹病毒感染。该药物到达体内之后可迅速转化为阿昔洛韦，再进入到被感染的细胞当中，从而抑制病毒DNA的合成，终止病毒的复制，从而达到抗病毒作用。后者常用于带状疱疹和原发性生殖器疱疹。该药物在进入人体的消化道后会接受消化道给予的刺激，转变为有活性，有治疗效果的喷昔洛韦，然后渗透进入受到了病毒感染的细胞内部，对DNA的合成以及遗传信息的传递进行抑制。
都是属于抗病毒类的口服药。这两种口服药的主要区别是，前者用于带状疱疹和水痘或者是单纯疱疹，后者除了使用于带状疱疹或者是单纯疱疹以外，也可以用于一些免疫力下降或者是其他病毒类感染的疾病，用于艾滋病导致的免疫严重受损伴发的病毒感染。
可以治疗带状疱疹，可以治疗单纯疱疹病毒感染，可以预防或抑制单纯疱疹病毒的复发。也治疗一型单纯疱疹病毒感染引起的单纯疱疹和二型单纯疱疹病毒感染引起的生殖器疱疹。服药的次数少，依从性更高。
盐酸伐昔洛韦可以在餐后服用，根据盐酸伐昔洛韦药代动力学数据，该药口服吸收迅速，几乎所有的药物都能被阿昔洛韦和缬氨酸吸收。这个转化的步骤是在人体的肝内进行的伐昔洛韦水解酶的水解，其可用性达到了54%，而且不会受到饮食的限制，也就是说，在服用之后，药物的效果不会受到任何的改变。少量病人在使用盐酸伐昔洛韦后会出现胃部不适、食欲减退、恶心、呕吐、腹痛、腹泻、便秘等轻微的胃肠反应。餐后使用也能降低药物对胃肠的刺激性，降低药物的副作用。
盐酸伐昔洛韦不能长期服用，伐昔洛韦主要用于治疗疱疹病毒导致的感染性疾病，治疗带状疱疹需要连服10天，单纯的疱疹需要治疗7天，生殖器复发性的疱疹需要用药不要超过6个月。
这种药就是用来治疗带状疱疹，单纯疱疹，生殖器疱疹，性财，皮肤科，神经内科这种疾病的，具有很强的消炎杀菌的作用。吃这种药要饭前空腹吃的，还有脱水或已有肝、肾功能不全者慎用。