碘与甲状腺呈因果关系，长期缺碘可引起地方性甲状腺肿、甲状腺功能减退症。
碘是人体必需的微量营养素，在体内具有非常重要的生理功能，是合成甲状腺激素的主要原料。研究表明，人体内碘大部分存在于甲状腺，碘缺乏和碘过多与甲状腺疾病的关系非常密切，也称为碘甲状腺功能亢进症，包括碘摄入过多引起的甲状腺功能亢进症。另外，碘在甲状腺疾病的治疗和预防中也有一定的作用，可以用碘-131治疗甲状腺功能亢进症。此外，甲状腺功能亢进症手术的前期准备可以使用碘剂，也可以使用碘剂治疗甲状腺中毒危象，甲状腺与碘的关系密切。
碘是甲状腺激素合成的重要因素之一。
如果碘摄入过多，会导致甲状腺分泌过多。因此，甲状腺功能不全的人要注意不要吃碘。但是，碘是正常人不可缺少的营养元素。如果长期碘摄入不足，会导致甲状腺增生。甲状腺炎分为急性化脓性甲状腺炎和亚急性甲状腺炎。这类患者可以正常饮食，不需要避碘。如果是慢性甲状腺炎，少量的碘对身体没有影响，但是不能吃太多，否则不利。
甲状腺结节的发生与碘盐有很大关系。
一般甲状腺结节是指结节性甲状腺肿，又称地方性甲状腺肿或单纯性甲状腺肿，该病病因与碘缺乏直接相关。碘是甲状腺激素合成的必需原料，碘摄入不足会引起甲状腺激素合成障碍，大量甲状腺球蛋白积聚在甲状腺腺体内，经过一段时间后形成结节，是结节性甲状腺肿。结节性甲状腺肿与当地水土碘缺乏有关，该病又称地方性甲状腺肿。据大爆发调查显示，高碘盐在全民普及后，该病发病率明显下降，高碘盐可预防结节性甲状腺肿。
碘与甲状腺关系十分密切，碘是合成甲状腺激素的必需物质。碘进入人体后进入甲状腺上皮细胞被摄取、浓缩，在甲状腺内合成甲状腺激素。一些甲状腺疾病的诊断和治疗是利用甲状腺摄取碘的特性，如碘-131治疗甲亢。
碘的摄入量有要求，世界卫生组织联合会、博儿基金会、国际碘营养管委会都有推荐碘的标准摄入量，碘过少会影响甲状腺功能。地区碘的营养状况影响甲状腺疾病的发病率，碘缺乏又称单纯性地方性甲状腺肿，克汀病发病率会升高，碘过量也会增加甲状腺炎、甲状腺结节的发病率。
矮小症与甲状腺减低关系如下：
甲状腺激素对组织的分化、发育和成熟起着至关重要的作用，甲状腺激素和生长激素可以促进身体的发育。如果甲状腺激素不足，那么生长激素的促生长效果就会减弱，因此，在应用生长激素的时候要定期进行甲状腺功能的监测，如果出现下降，就要及时口服甲状腺激素。此外，甲减的孩子还会有青春期的发育延迟，这就会导致甲减的孩子和普通孩子的身高差距，甲减的孩子在出生时身高、体重都是正常的，但是在出生后就会变慢，因为生长速度慢，孩子吃的东西也会减少，所以会有腹部胀大、大便秘结等症状。如果不及时治疗的话，他的体格会比一般的孩子更加的矮小。
甲状腺与血糖关系十分密切，甲状腺激素合成、分泌过多，甲状腺激素是主要的升糖激素，机体血糖可能升高。甲状腺功能亢进症患者可能发生血糖升高，多以餐后血糖升高为主要表现。研究表明，甲亢血糖升高随着甲亢治疗的好转，血糖也逐渐恢复正常，血糖升高与甲状腺激素水平密切相关。
出现甲状腺功能亢进症，除血糖升高外，患者还可表现为恐慌、出汗、怕热、进食过多、大便次数增多，女性患者表现为月经紊乱，以月经量减少为特征，可表现为心律失常、心房颤动。发生甲状腺功能亢进症时，给予抗甲状腺药和核素碘-131或甲状腺的手术治疗。具体治疗方案由医生根据患者病情给予综合判断。