甲状腺炎的治疗通常经内科保守治疗即可，治疗费用的高低，主要取决于疾病和病人临床表现。
部分较轻之甲状腺炎，例如，较轻者桥本氏甲状腺炎，通常无需特殊处理，仅需常规复查甲状腺功能或甲状腺超声。若为较严重甲状腺炎，由于病人临床表现较严重，因此，在处理上也有较多措施，而病情严重的人，也许会在花费上付出更多的。另外还有一种情况就是严重程度比较高，并且伴有全身症状的疾病，这类疾病通常需要通过手术进行治疗，但是这种情况下耗费时间长，费用较高。由于治疗期间需经常检查和复查，依据检查结果，对治疗方案进行调整，因此，耗费的成本可能会更高。还有就是对于部分症状较轻微的甲状腺炎，没有什么特殊情况的话，不用太担心，但是有些严重的则必须考虑到手术问题了。甚至有些甲状腺炎还相当严重，需配合外科手术治疗，则耗费可能稍多。另外对于不同类型的甲状腺疾病来说，其具体治疗方式和效果都存在一定的差别。因此，甲状腺炎治疗费用的高低，主要取决于疾病和病人临床表现，不同的疾病，耗费的费用就不同。
甲状腺穿刺费用一般在300-2000元左右。甲状腺穿刺是一种来确定甲状腺方面疾病的检查手段，不过做甲状腺穿刺是可以分为好几部分的，一般来说，做穿刺和活检的费用是300多元，不过使用的穿刺针不同会对价格造成一定的影响。如果要做涂片检查，可能也需要几百元，不过一般总体来说价格不会超过1000元。在一些私人医院甲状腺细针穿刺活检的费用大约在600-800元左右，包括超声费用，病理检查的费用。如果使用一次性专用穿刺枪，那么费用还要增加1000到2000元。
碘131治疗甲状腺癌费用大约1000-2000元左右。费用没有一个统一的金额标准不同的地方，不同的医院针对不同的病证费用可能会有所不同，一般的说在一、二线的大城市的医院，要比三、四线的普通的医院的碘131治疗甲状腺癌的费用要增高。
一般甲状腺炎好治疗。
大多数的甲状腺炎症是无法自行治愈的，只有少数患者，例如轻症亚急性甲状腺炎，能够在不进行任何处理的情况下自行痊愈。甲状腺炎分为很多类型，每个类型都有自己的处理方法，导致甲状腺炎的结果也是不一样的。有些是因为长期的，有些是因为长期不退，有些是因为经过了正规的治疗，有些则是出现了复发。如果出现了甲亢，一定要到医院的内分泌科室进行正规的检查，避免耽误了最佳的治疗时间，一般治疗难度不大。
桥本氏甲状腺炎的病人应到内分泌科进行规范的求诊。
桥本氏甲状腺炎为内分泌科较为多见的甲状腺自身免疫性疾病之一，由遗传因素与环境因素交互作用而形成，具有一定家族聚集性，常见于妇女，故妇女激素可能和本病的发病有关。其临床特征多样，可能与甲状腺自身免疫过程相关的基因较多，其具体病因目前尚不十分明确，因此甲状腺炎目前尚无特异性治疗手段。
大多数病人无需处理，诊断后需随访观察。临床上存在甲减的患者主要是对甲状腺功能减退采用甲状腺激素的恰当替代治疗。