中医治疗肛瘘病可以用熏洗疗法，主要用于术前术后的治疗，起到消肿止痛的效果。药物可以用：菊花，黄柏，蒲公英等。主要起到清热解毒，消肿止痛，祛湿止痒的功效。可以先熏蒸，然后再用药水进行外洗。
这通常必须手术治疗。效果会更好。可以用热毛巾敷在腹部，顺时针方向按摩。可以选择三级以上的医院做手术。术后注意护理。每天用清水清洗肛门，用温水洗澡，注意饮食，多喝水，多吃易消化的食物，少吃刺激性食物，不要吃冷、硬、辣的食物。
肛瘘是由于各种原因导致的肛管和外部皮肤之间出现瘘管，分为高位肛瘘和低位肛瘘，其最常见的就是肛旁脓肿，甚至会有粪性分泌物从外口出来。需要及时选择专业的医院进行检查，并根据检查结果进行科学的针对性治疗。
中医不太适合。肛瘘的治疗目标是尽可能减少括约肌损伤，消除肛瘘内口和任何相通的上皮化瘘管。可以到正规大医院肛肠科好好咨询一下，如果病情轻，可以采用保守治疗。如果药物效果不好，或者病情继续加重，就需要做手术了，通过手术将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织切除，使伤口自基底向上逐渐愈合。
肛瘘是最为常见的肛肠科疾病之一，表现为反复的红肿疼痛。肛门附近有渗出，对身体健康造成很大的影响，多见于肛周脓肿后。还是及时到肛肠科就诊，诊断明确以后需要及早手术，平时多吃蔬菜水果，粗粮保持大便的软化，不能抽烟喝酒。