甲状腺癌滤泡癌晚期用放射治疗比较好，可以用放射性碘元素治疗。如果是甲状腺癌晚期，往往伴有体内的一些转移灶，因此治疗起来相对比较麻烦，但是前期也要通过手术的切除的办法把更多的瘤体切掉。
现在主要是甲状腺癌发生了淋巴转移，对身体的影响是很大的，会出现淋巴结肿大，可以转移在身体的多种部位，切除可能已有转移的颈部淋巴结也是经常采用的方法。甲状腺癌的术后处理，是进行甲状腺激素治疗。如果甲状腺全部切除，必须用甲状腺激素治疗，即使甲状腺不是全部切除，也应用甲状腺激素治疗。
化学治疗：分化型甲状腺癌对化疗反应差，仅有选择的和其他治疗方法联用于一些晚期局部无法切除或远处转移的病人。外科治疗：外科治疗甲状腺癌主要涉及两个问题，一是对可疑为癌的甲状腺结节如何正确处理，二是对已确诊的甲状腺癌应该采用何种最佳治疗方案。
甲状腺癌的手术治疗是其主要治疗方法，包括甲状腺本身的手术，以及颈淋巴结清扫。不论病理类型如何，只要有手术指证就应尽可能手术切除。对分化好的乳头状癌或滤泡癌，即使是术后局部复发者也可再次手术治疗。
甲状腺癌在手术之后需要定期的复查随访的，就是通过复查随访看看有没有肿瘤复发或者是转移的可能性，还有就是需要复查甲功能，这个就是看看当初的手术治疗后会不会导致甲肝的，还有就是看看需不需要补充甲状腺激素类的药物。
甲状腺癌一般根据类型，其预后是不一样的，一般甲状腺乳头状癌，及髓样癌恶性程度不高，手术后预后较好率高，但是未分化虽然临床少见，甲状腺癌也是有生命危险的，因为这毕竟是属于恶性肿瘤，肿瘤是可以出现转移和扩散的，最终危及生命，但是甲状腺癌的恶性程度比较低，在恶性肿瘤中算是预后比较好的肿瘤，一般都能够长期生存，大多数能够存活十多年，甚至更多。