注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。如已查出患有子宫内膜异位症，卵巢巧克力囊肿大于6cm以上者，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累，一旦囊腔内张力突然升高时，囊壁破裂，会形成急腹症。月经期要做好自身的保健，注意控制自己的情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌的改变。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型。其中，卵巢巧克力囊肿又占80％左右。卵巢巧克力囊肿病变可只累及一侧卵巢，但约有50％以上的病人会累及双侧卵巢。随着病情的发展，病人可出现痛经、持续性下腹疼痛、月经失调、不孕和性交痛等病症。
巧克力囊肿可多吃些玉米等的五谷杂粮，提倡多样化饮食，平时可以多吃些芝麻、花生、瓜子等，维持营养所需，应该坚持低脂肪饮食，多吃瘦肉、鸡蛋、绿色蔬菜、海带、香菇以及新鲜水果等。
囊肿属于良性病变，对身体没有很大的影响，可以不做治疗或用中药调理，一般也没有什么特效药。有必要时可以考虑手术切除，巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的其中一种，要高度重视积极正确治疗。西医手术以及激素治疗复发几率高，可考虑中医保守治疗。
巧克力囊肿手术的复发率较高，因囊肿与周围组织粘连紧密，手术中囊肿一旦破裂，囊液外流，到其它部位种植，引起复发。如果以后有复发，就不要再采取手术治疗，其实现在巧克力囊肿囊肿的治疗应该首选介入治疗，因此种方法治疗巧克力囊肿明显高于手术，且不会造成复发，是治疗巧克力囊肿方法，手术后没什么药物治疗措施，目前只能先观察，如果有复发，再考虑采取何种治疗方法。
可以口服一些抑制生长肿瘤的激素，或别的药物，来干预，可以得到一定的缓解，疼痛，就要口服一些，止疼药物，来缓解，还是要通过大夫再确定能不能口服，还可以给病人，做一些按摩，来缓解。