治疗女性卵巢囊肿一般采用手术切除的方式，但是多数病人不愿接受，因费用高、留伤口。切除后易在原来的部位复发或对侧又长出囊肿等缺点，不是恶性囊肿病人一般不会选择手术治疗。囊肿小于5cm。用中药丹桂消聚贴治疗可起到事半功倍的疗效。
怀孕前卵巢囊肿可能是由于体内激素的刺激，导致卵巢囊肿增大，但是怀孕初期不会出现卵巢囊肿疼痛。
怀孕初期受体内激素的刺激，只会使囊肿增大，而不会引起囊肿的破裂和扭转。如果是卵巢巧克力囊肿，怀孕后卵巢巧克力囊肿会慢慢萎缩，所以卵巢巧克力囊肿不会引起疼痛，反而会随着孕周的增加而逐渐萎缩变小，甚至有可能是怀孕后自愈。
一般情况下，怀孕初期卵巢囊肿治疗要根据囊肿的性质和患者的症状决定。
1.如果囊肿直径在5cm以上，一般需要进行手术治疗，避免卵巢囊肿破裂引起急腹症。
2.如果是良性的生理性囊肿，囊肿直径在5cm以下，患者没有明显的临床症状，一般不需要特殊治疗。
日常生活中，应注意个人卫生，饮食清淡，作息规律，多休息，保持良好的心态，注意合理运动，增强自身的体质，有利于身体健康。
一般情况下，怀孕初期有卵巢囊肿可能是激素水平变化造成的，具体内容如下：
在怀孕后，女性体内激素水平变化，女性的卵巢会产生一种叫做“黄体”的物质，黄体会分泌一些激素来保证女性的正常孕期，这种情况下，黄体也会逐渐增大，可能会出现卵巢囊肿，这其实是黄体体积变大导致的卵巢的黄体囊肿。一般怀孕2个多月后，黄体就会慢慢的出现胎盘，这时候的卵巢囊肿就会慢慢的消失，因此，女性无需过度紧张，定期进行产检，明确自身情况即可。
卵巢囊肿蒂扭转是一种常见的妇科急腹病，大约10%的患者会出现蒂部扭曲。一旦发现，立即进行外科治疗，以切除患者一侧的肿瘤及一侧的附件为主。瘤蒂较大，中心向一边倾斜，其蒂部在突变时可能会出现，而扭转的蒂取取自盆腔的漏斗韧带、卵巢固有韧带及输卵管。临床上常见的临床表现为：体位性变化后，会出现一种突发性的腹痛，并伴有恶心、呕吐、休克等。如果出现该情况，建议患者及时进行治疗。
卵巢囊肿初期症状有胃肠道症状：更年期女性如果经常感觉腹胀、食欲不振；外阴及下肢水肿：随着卵巢癌肿的增大，盆腔静脉受压，导致血流不畅，妨碍淋巴回流，致使外阴及下肢出现水肿。月经过少或闭经：多数卵巢癌病人的月经基本无变化，随着癌肿增大，癌细胞会破坏卵巢正常组织，导致卵巢功能失调，引起月经过少或闭经。