子宫内膜异位最佳怀孕方法是手术治疗。
如果出现一个六七厘米以下的卵巢囊肿，可以考虑是自然妊娠半年，如果不成功，可以进行促排卵或者手术。术前要进行AMH检查，以了解卵巢的功能，如果卵巢功能正常，可以选择手术。为了防止术后出现的卵巢功能减退和排卵异常，可以在术前进行冰冻。术后要尽快进行促排卵，或者去专业的不孕专家进行体外受精。
根据每个病人的具体情况进行个体化的手术治疗。经腹腔镜手术还是开腹手术取决于操作者的经验和技术，不完全取决于疾病期别。子宫内膜异位症手术治疗通常有三种方式，即保留生育功能的手术，保留卵巢功能的手术。
子宫内膜异位症可以采用热敷的方式来缓解症状，中医治疗子宫内膜异位症能有效缓解子宫内膜异位症引起的疼痛感，也可以通过激素疗法进行治疗，但是要在医生的指导下正确的用药，平时需要加强护理，并且严重者要考虑手术治疗。
内膜异位症指的是族内膜异位到子宫以外的位置，比如子宫肌层，卵巢以及盆腔的腹膜，膀胱的位置，如果大于40岁，还是要考虑手术治疗，40岁之内，如果有生育的要求，选择药物性的保守治疗。
子宫内膜异位是因某种因素，使子宫内膜在身体其他部位生长，平时可进行慢跑，健身操，瑜伽等方法锻炼，用时应该采用药物治疗，服用激素类药物，令异位子宫内膜组织萎缩。
治疗方法有药物治疗和手术治疗两种。药物治疗一般是通过激素类药物来进行治疗，另外避孕药和中成药对子宫内膜异位也有一定的疗效。手术治疗是指直接将病灶切除，但术后也需要药物治疗来补充巩固疗效。