治疗方法分药物和手术治疗，效果较好的就是手术，分为保留生育功能手术和保留卵巢功能的手术。仅切除内膜异位病灶，保留卵巢和子宫。适用于年轻、想保存生育机能者。严重会切除的子宫附件和病灶，这样就会导致彻底失去生育能力。
子宫内膜异位保持适当的活动。注意休息和饮食，保持心情愉快。子宫内膜异位症的治疗方案，因病情的轻重，病人的年龄和生育情况而有所不同。如病情较重，或表现为重的痛经，或盆腔检查发现有肯定的内膜异位结节，需要采取药物或手术治疗。
宫内膜异位症的治疗方案，年龄和生育情况而有所不同。如病情较重，或表现为重的痛经，或盆腔检查发现有肯定的内膜异位结节，就必须采取药物或手术治疗。采用药物来对抗或抑制卵巢的周期性内分泌刺激。最初是用睾丸酮类的雄性激素，因副作用较大，而且效力亦不够强，已逐渐摒弃不用。后来则逐渐发展成为假孕疗法及假绝经疗法。
子宫内膜异位症没有很好的办法，但是通过手术治疗或者保守治疗可以缓解症状。保守治疗主要是可以应用药物，抑制子宫内膜异位病灶的生长。做一个全身检查，根据自己情况来治疗。
子宫内膜异位症，可能会导致不孕的情况发生，而且怀孕了也有可能导致流产。医院进行正规的治疗，尽量的控制病情，才能够更好的备孕。建议夫妻双方都要进行备孕的检查，尽量生出健康的宝宝，不要太过担心，保证良好的心态。
子宫内膜异位症的临床表现包括痛经、非经期盆腔疼痛、性交疼痛，以及排卵期疼痛、便秘、排尿困难等其他罕见症状，严重影响着生育期女性的生活质量，内在性子宫内膜异位症，月经量往往增多，经期延长。