卵巢囊肿蒂扭转是一种常见的妇科急腹病，大约10%的患者会出现蒂部扭曲。一旦发现，立即进行外科治疗，以切除患者一侧的肿瘤及一侧的附件为主。瘤蒂较大，中心向一边倾斜，其蒂部在突变时可能会出现，而扭转的蒂取取自盆腔的漏斗韧带、卵巢固有韧带及输卵管。临床上常见的临床表现为：体位性变化后，会出现一种突发性的腹痛，并伴有恶心、呕吐、休克等。如果出现该情况，建议患者及时进行治疗。
可以采用手术治疗方法，良性卵巢囊肿的手术治疗，卵巢囊肿切除术，尤其是绝经前多采用此种术式，输卵管卵巢切除术，适用年龄较大或绝经后的，恶性卵巢囊肿的手术治疗，多采取卷地毯式将子宫与肿瘤连同盆腹膜整块切除，也可考虑在腹腔内留置导管，以便术后腹腔内注射化疗药物等使用。
大多数的卵巢囊肿是良性的，囊肿直径大于5厘米，一般需要手术治疗。如果比较小可以用药物治疗一下，定期做好复查的。左侧卵巢囊肿施行手术的一个目的是排除恶性倾向。手术可采取开腹或腹腔镜。
卵巢囊肿多数是由妇科炎症引起的，先吃一些抗炎药物等月经干净，三天之后需要复查彩超，看是否有减小的趋势，囊肿大小不超过五厘米，如果有效果当然更好，如果观察超过五厘米，可以考虑手术治疗。
一般生理性的囊肿都会消失的，不用处理。病理性的卵巢囊肿如果体积小于3.0厘米，一般不需要治疗。在3到5厘米之间时要定期复查，5.0厘米及上时可以考虑手术治疗。卵巢囊肿手术治疗一般只需要剔除囊肿，不会切除子宫。平时鉴定，主要是通过连续监测三个月，如果月经第三天的时候，卵巢处的囊肿持续性存在，一般诊断为病理性。