卵巢囊肿的治疗方案包括有良性的治疗，也包括有恶性的治疗，如果是良性的囊肿的话，病变比较小，而且比较轻微，大多是由于炎症感染所引起的病情。可以选择合适的药物进行治疗，可以取得良好的治疗效果，如果是囊肿比较大，出现有局部压迫的症状，需要及时进行手术治疗，如果是恶性病变的话，就需要及时进行手术治疗、放疗、化疗或者联合治疗。
非手术治疗方式是卵巢囊肿治疗的常见手段，非手术治疗卵巢囊肿的方法很多，常见的治疗方法有中医中药，药物治疗，物理治疗方法等。由于不同卵巢囊肿治疗方法具有各自的优缺点及适应症，为更好的发挥各种卵巢囊肿方法在治疗卵巢囊肿方面的积极作用，避免治疗误区，要注意病情。
卵巢囊肿的治疗方法主要是手术治疗。必要时需要配合化疗药物进行治疗。
如果卵巢囊肿为良性，有生殖需求，可以采取手术摘除，尽量保存正常的卵巢。若无生殖需求，则需将一侧或两侧的输卵管及卵巢摘除。卵巢囊肿为恶性肿瘤，应尽量将原发囊肿和转移灶进行切除，术后应在腹腔中放置导管，并通过腹腔内注入化疗药物来进行预防。
手术后，患者应该注意休息，不要过度劳累，以免撕裂伤口。
左侧卵巢囊肿，如果患者的囊肿已经确诊为病理性囊肿，可以在医生指导下通过手术治疗，如开腹手术、腹腔镜手术等。腹腔镜的手术损伤比较小，身体恢复得会快一些，但手术得费用也会相对较高。建议患者在手术后需要将剔除的囊肿送病理化验，并定期复查，了解自身身体的恢复情况，因为如果患者得囊肿属于卵巢巧克力囊肿，复发性会比较高。
囊肿可有生理性、病理性，有良性、恶性，有的要手术，有的不手术，有的会复发，有的不容易复发。对于不同类型的卵巢囊肿，有不同的治疗方法，要正规的专科医院检查了解自己患有哪种卵巢囊肿，然后再做出正确、有针对性的治疗。
左侧卵巢，如果已经确诊为病理性囊肿，那么在临床上要给予手术治疗，可以做开腹手术，也可以做腹腔镜手术。腹腔镜的手术损伤小，恢复会快一些，但是价钱也会贵一些。术中绝大部分会采取囊肿剔除手术的方式，保留卵巢组织，并且将剔除的囊肿送病理化验。
