卵巢囊肿不能通过食疗的，当然如果是生理性的黄体囊，不需要特殊治疗，如果是病理性的卵巢囊肿包括手术治疗和保守抗炎治疗。如卵巢占位大于五公分，需进行手术治疗，同时结合检查、症状、病史进行综合判断；如为炎性囊肿，可进行抗炎治疗；囊肿年龄与囊肿生长速度相关，绝经后新发卵巢占位，需进行手术治疗；育龄期女性，需根据月经周期和生长速度进行诊断。
饮食适宜：宜吃清淡饮食，多吃些蔬菜水果。宜吃有补益气血作用的食物。宜吃有理气散结、消肿活血作用的食物。比如香菇，香菇还含有多种维生素、矿物质，对促进人体新陈代谢，提高机体适应力有很大作用。
多吃一些碱性的食物，如红豆、豆腐、苹果等，这是卵巢囊肿的食疗方法中重要的一项，同时也可帮助一些女性做好卵巢囊肿的预防工作，此外，在日常生活中，卵巢囊肿应以清淡饮食为主，不要吃含油较多或者是刺激性比较的食物。在医生指导下对症治疗，可以考虑保守治疗，如果有特别严重的症状也可以考虑手术切除治疗。
治疗期间应节房事，忌生冷、香燥、酒类、辛辣饮食，可以尝试苹果醋的，在卵巢囊肿的顶级天然治疗中，苹果醋被认为是最有效的方法之一。这是因为苹果醋可以消除和溶解由于缺乏钾而导致的囊肿。
宜多吃有抗卵巢肿瘤作用的食物；出血宜吃羊血、乌贼、藕；感染，宜吃鳗鱼、水蛇、芹菜、油菜、香椿等；腹痛腹胀，宜吃猪腰、杨梅和核桃，另外还要忌烟酒，咖啡忌辛辣刺激，发霉烧焦的食物。
在临床上要给予手术治疗，可以做开腹手术，也可以做腹腔镜手术。腹腔镜的手术损伤小，恢复会快一些，但是价钱也会贵一些。术中绝大部分会采取囊肿剔除手术的方式，保留卵巢组织，并且建议将剔除的囊肿送病理化验，根据病理结果临床再决定下一步的治疗方案。
