药流有残留不清宫会造成月经周期紊乱，月经过多。残留组织就会发生疾患，就是变成硬的，和子宫肌壁难以区分。这个时候，女性就会出现月经周期的紊乱。因为残留组织机化之后，会影响子宫内膜正常的修复和正常的剥脱，也就是会影响女性月经周期，比如出现来月经的时候月经量比较多，或者是月经时间持续比较长。残留组织面积比较大，还会影响受精卵正常的着床，也就是影响正常怀孕。建议：一般在药流后7天去医院复查，宫腔内有残留，如果出血不多可以观察，如果出血多必须第一时间做清宫术。
如果确认是没流干净，就必须及时进行清宫手术，如果不清宫会得严重的妇科炎症，对以后生宝宝也是有很大影响。药流会有失败的风险，当药流不干净，就必须进行二次进行清宫，否则会导致宫内感染，盆腔炎，附件炎，输卵管炎合并堵塞，不孕不育等，甚至引起大出血危险生命。建议到正规医院做药流，休息1-2周，避免干重体力活和冷水作业，以免身体抵抗力降低而诱发其他疾病。同时还要加强营养，多吃高蛋白及补气血的食物，有利于术后身体的恢复。
通常情况下，药流一直不干净会导致身体不适、宫腔感染等。具体分析如下：
1.身体不适：如果药流一直不干净，阴道出血量明显增多且时间显著延长，可能会导致下腹部阵发性疼痛感或伴有坠胀感；
2.宫腔感染：如果药流一直不干净，可能会导致宫腔感染，做妇科检查时可见子宫区有明显压痛，还有发热症状。药流后出现上述症状，建议患者及时去医院复查彩超明确胚胎组织残留量，确定是否需要服用益母草颗粒或新生化颗粒，又或者可以考虑进行清宫手术。
药物流产的成功率在90%以上，还是很好的。药物流产在时间上有要求，还存在着一些禁忌症。药物流产适用于停经49天以内，超声确认是宫腔内怀孕，而且孕囊大小在2.5厘米以内。使用药物者年龄为18到40岁之间的女性，而且身体健康对药物没有过敏史。
需要做子宫双附件彩超，明确宫腔内是否有残留，如果没有流干净，有可能会有阴道持续少量出血，药流后会出血7-10天，最多不超过15天，如果没有流干净可能一直会有出血症状。
药流之后查看排出的孕囊是否是完整的，如果是完整的再做个B超，查看宫腔内有无残留，如果孕囊完整宫腔内也无残留，那么就说明流干净，也就是药流成功了。两周左右上医院复查做B超就能知道是否流干净。